RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477886.5

PRKRIP1-205, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 986 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-205ENST00000477886 TWNKQ96RR1 684 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNAI2Q9GZS0 605 aa25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 FAM92AA1XBS5 289 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 C4orf47A7E2U8 309 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TPGS1Q6ZTW0 290 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 CLEC20AQ6ZU45 233 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TAS1R2Q8TE23 839 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.1■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 NUP205Q92621 2012 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 PATE3B3GLJ2 98 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TM4SF5O14894 197 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 RHOBTB3O94955 611 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 WASP42768 502 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADAM9Q13443 819 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZNF394Q53GI3 561 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 GRAMD4Q6IC98 578 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 FRMD1Q8N878 549 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ERLEC1Q96DZ1 483 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 BBS2Q9BXC9 721 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 NIF3L1Q9GZT8 377 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYP3A43Q9HB55 503 aa25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 A0A0A0MRY4 1105 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 A0A1W2PQH9 124 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 LNP1A1A4G5 178 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TRIM24O15164 1050 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 MAPK13O15264 365 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ADAM23O75077 832 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 KCNK5O95279 499 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 PPP3CAQ08209 521 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 DPYDQ12882 1025 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 PHTF2Q8N3S3 785 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 TERB1Q8NA31 727 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 SCML2Q9UQR0 700 aa25.08■■□□□ 1.61
PRKRIP1-205ENST00000477886 MDM4O15151 490 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 RARGP13631 454 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 HOXB2P14652 356 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 P2RY2P41231 377 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 INCA1Q0VD86 236 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 C10orf120Q5SQS8 335 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 HTR3DQ70Z44 454 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 OLIG1Q8TAK6 271 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 BHMTQ93088 406 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM9BQ9NQ34 198 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 OSER1Q9NX31 292 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 NAGPAQ9UK23 515 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa25.07■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 TYRP14679 529 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ST3GAL2Q16842 350 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 UAP1L1Q3KQV9 507 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 SDE2Q6IQ49 451 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 NMUR1Q9HB89 426 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 CYLDQ9NQC7 956 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 DNMT3LQ9UJW3 386 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.06■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 SPTBN2O15020 2390 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 HHLA1C9JL84 531 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 CILPO75339 1184 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 NFIL3Q16649 462 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 MIB1Q86YT6 1006 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHPFQ8IZ52 775 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 DEFB119Q8N690 84 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 WDR35Q9P2L0 1181 aa25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 KRT37O76014 449 aa25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 RALAP11233 206 aa25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 NTSR1P30989 418 aa25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 PTGER3P43115 390 aa25.04■■□□□ 1.6
PRKRIP1-205ENST00000477886 PLA2G4AP47712 749 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms