RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463829.1

USP9X-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, human

TSL 3

Gene USP9X, Length 666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP9X-204	ENST00000463829	ST3GAL2	Q16842	350 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	PRR16	Q569H4	304 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829		Q6ZWC4	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	PRR25	Q96S07	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829		A8MVJ9	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	NTSR2	O95665	410 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	NPS	P0C0P6	89 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	TMEM225B	P0DP42	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CREB1	P16220	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	TYRP1	P17643	537 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	PROZ	P22891	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	YY1	P25490	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CTGF	P29279	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	HTR7	P34969	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	E2F1	Q01094	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	ACOX1	Q15067	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	WDR24	Q96S15	920 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
USP9X-204	ENST00000463829	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829		H0YIZ8	118 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SYT5	O00445	386 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	CES2	O00748	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SPRY2	O43597	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	WDR47	O94967	919 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	NPPB	P16860	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	CHKA	P35790	457 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SERPINF1	P36955	418 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	USP1	O94782	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	FGA	P02671	866 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ITGA5	P08648	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	BMP5	P22003	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	DGKQ	P52824	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	POLE2	P56282	527 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SOX10	P56693	466 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	MTAP	Q13126	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	GORAB	Q5T7V8	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	EID2B	Q96D98	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
USP9X-204	ENST00000463829	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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