RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	CCT6B	Q92526	530 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DUSP16	Q9BY84	665 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DSE	Q9UL01	958 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GINS2	Q9Y248	185 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR182	O15218	404 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNN4	O15554	427 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CA4	P22748	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PCSK1	P29120	753 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	IFNAR2	P48551	515 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RASSF2	P50749	326 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DBN1	Q16643	649 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PDK4	Q16654	411 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CDO1	Q16878	200 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	CYS1	Q717R9	158 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RPAIN	Q86UA6	219 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	KAT2B	Q92831	832 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	TBK1	Q9UHD2	729 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	IPP	Q9Y573	584 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPRD	P23468	1912 aa		11.96	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	OPHN1	O60890	802 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	KRT38	O76015	456 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	OAS1	P00973	400 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MT-ND3	P03897	115 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ALAD	P13716	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	NPR3	P17342	541 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2F1	P24903	491 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJB2	P25686	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	HTR7	P34969	479 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RGS7	P49802	495 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	LILRA4	P59901	499 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP11A	P98196	1134 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ORC1	Q13415	861 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PDK1	Q15118	436 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	QPCT	Q16769	361 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL23	Q86XA0	190 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CDKL2	Q92772	493 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	UROC1	Q96N76	676 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	PAFAH2	Q99487	392 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS11	Q9H270	941 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-222	ENST00000459758	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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