RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437652.5

UBAP2L-209, Transcript of ubiquitin associated protein 2 like, human

TSL 3

Gene UBAP2L, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBAP2L-209	ENST00000437652	STX10	O60499	249 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CREB5	Q02930	508 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	HTR3D	Q70Z44	454 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RASSF3	Q86WH2	238 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	WBP2	Q969T9	261 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RMND1	Q9NWS8	449 aa		27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	HHLA1	C9JL84	531 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	LIMK1	P53667	647 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF394	Q53GI3	561 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPM1J	Q5JR12	505 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TTC39C	Q8N584	583 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	WHAMM	Q8TF30	809 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	DUSP16	Q9BY84	665 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CYLD	Q9NQC7	956 aa		27.56	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	SGK1	O00141	431 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CYP26A1	O43174	497 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TULP3	O75386	442 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CAVIN2	O95810	425 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RARG	P13631	454 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PLA2G4A	P47712	749 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PNOC	Q13519	176 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RAB20	Q9NX57	234 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652		A0A1W2PQH9	124 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	SEMA4D	Q92854	862 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TSG101	Q99816	390 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	NMUR1	Q9HB89	426 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	OSER1	Q9NX31	292 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	NAGPA	Q9UK23	515 aa		27.54	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	NUP205	Q92621	2012 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PRCP	P42785	496 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PSEN1	P49768	467 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	MXI1	P50539	228 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	KIF11	P52732	1056 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	STPG1	Q5TH74	334 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PGBD3	Q8N328	593 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	MAP3K13	O43283	966 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	SMC2	O95347	1197 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	RALA	P11233	206 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	KCNA4	P22459	653 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	BECN1	Q14457	450 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	GSDMA	Q96QA5	445 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	BBS2	Q9BXC9	721 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	CISH	Q9NSE2	258 aa		27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	27.52	■■■□□ 2
UBAP2L-209	ENST00000437652	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	PMS2CL	Q68D20	193 aa		27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	TATDN2	Q93075	761 aa		27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	27.51	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	GREM1	O60565	184 aa		27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	ADAM23	O75077	832 aa		27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	ADRB1	P08588	477 aa		27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	SLC8A3	P57103	927 aa		27.5	■■□□□ 1.99
UBAP2L-209	ENST00000437652	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	27.5	■■□□□ 1.99

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