RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WWL8 130 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JK05 382 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF432O94892 652 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 GAS1P54826 345 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 MTMR1Q13613 665 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-202ENST00000367364 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-202ENST00000367364 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.85□□□□□ -1.63
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PTPRC-202ENST00000367364 CD63P08962 238 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 RHCEP18577 417 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-202ENST00000367364 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRC-202ENST00000367364 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ATG13O75143 517 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 UQCRC1P31930 480 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 PTGR1Q14914 329 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 SPARTQ8N0X7 666 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.83□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 LMO3Q8TAP4 145 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 GPC5P78333 572 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 CPA4Q9UI42 421 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 TNKSO95271 1327 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 MLH1P40692 756 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 EGR4Q05215 589 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-202ENST00000367364 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 DSCR9P59020 149 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ITKQ08881 620 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 CTBP1Q13363 440 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 TRILQ7L0X0 811 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ELP5Q8TE02 316 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 MTMR8Q96EF0 704 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-202ENST00000367364 ARMT1Q9H993 441 aa4.79□□□□□ -1.64
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