RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 AADACL2Q6P093 401 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC20AQ6ZU45 233 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HDXQ7Z353 690 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 NECAB2Q7Z6G3 386 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC105Q8IYK2 499 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PRELID2Q8N945 189 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD6Q8NC69 237 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HASPINQ8TF76 798 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HDAC7Q8WUI4 952 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SMARCD1Q96GM5 515 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM175Q9BSA9 504 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC19Q9H756 370 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ZWILCHQ9H900 591 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF3Q9NR23 364 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT82Q9NSB4 513 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 AMACRQ9UHK6 382 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 NR2E1Q9Y466 385 aa10.58□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TBKBP1A7MCY6 615 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 NRP1O14786 923 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HSF2BPO75031 334 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCAB14O75071 495 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT1P04264 644 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MIPP30301 263 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FLT3P36888 993 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 COILP38432 576 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CUL1Q13616 776 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNG2Q16589 344 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP1B1Q16678 543 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC14Q49A88 953 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TFDP3Q5H9I0 405 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA0319Q5VV43 1072 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CNKSR3Q6P9H4 555 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM35AQ86V20 835 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ATL2Q8NHH9 583 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 IFT81Q8WYA0 676 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM149B1Q96BN6 582 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SLITRK1Q96PX8 696 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TBCBQ99426 244 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HEMGNQ9BXL5 484 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CNGB3Q9NQW8 809 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM114A2Q9NRY5 505 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TBX21Q9UL17 535 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN1AP35498 2009 aa10.57□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CARNS1A5YM72 827 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PI4K2BG5E9Z4 385 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 H7C4K7 107 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ITGB1P05556 798 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 KDELR1P24390 212 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 GBP1P32455 592 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN7P35236 360 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MATKP42679 507 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TKTL1P51854 596 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 LBX1P52954 281 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP11AP98196 1134 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ADIGQ0VDE8 80 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 PDK2Q15119 407 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF5Q15542 800 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 EMBQ6PCB8 327 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 RAPGEF5Q92565 580 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 SMOQ99835 787 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 HINFPQ9BQA5 517 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 RTP3Q9BQQ7 232 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 ERP44Q9BS26 406 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms