RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TMLHEQ9NVH6 421 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.73■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NBNO60934 754 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TFDP2Q14188 446 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 GPNMBQ14956 572 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FAM171BQ6P995 826 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf228Q6PIY5 440 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 STRADAQ7RTN6 431 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PQLC3Q8N755 202 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SMARCD1Q96GM5 515 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TSC2P49815 1807 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RBP3P10745 1247 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 KRT71Q3SY84 523 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NOMO2Q5JPE7 1267 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SYPL2Q5VXT5 272 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 OVOS1Q6IE37 1185 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 UNC45BQ8IWX7 931 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 P3H4Q92791 437 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SUSD3Q96L08 255 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DSEQ9UL01 958 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.72■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 HHLA1C9JL84 531 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DNM1LO00429 736 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MCF2LO15068 1137 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 L1CAMP32004 1257 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NOMO1Q15155 1222 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 LRRTM3Q86VH5 581 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 FAM131BQ86XD5 332 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PLD5Q8N7P1 536 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 BDNFP23560 247 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NOS2P35228 1153 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DSC1Q08554 894 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 DPYSL2Q16555 572 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 RAB41Q5JT25 222 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 PKMYT1Q99640 499 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF670Q9BS34 389 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa23.71■■□□□ 1.39
VSTM4-201ENST00000298454 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 E7ENQ6 273 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FYNP06241 537 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L7P0C7H9 530 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NRLP54845 237 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DAOAP59103 153 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 MTFR1Q15390 333 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FAM71DQ8N9W8 422 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C3BQ969T7 300 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FTHL17Q9BXU8 183 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 POPDC2Q9HBU9 364 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TBC1D13Q9NVG8 400 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 COX16Q9P0S2 106 aa23.7■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 APOL1O14791 398 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SKIDA1Q1XH10 827 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 SLC9A4Q6AI14 798 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 COLGALT2Q8IYK4 626 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 URGCPQ8TCY9 931 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FAF2Q96CS3 445 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DEFB118Q96PH6 123 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 NPY6RQ99463 290 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 TSPYL1Q9H0U9 437 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 HEY1Q9Y5J3 304 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO21O94952 628 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K6O95382 1288 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 ACSL3O95573 720 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 PAX3P23760 479 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 OR1G1P47890 313 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 VSIG1Q86XK7 387 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.69■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 M0QYT0 321 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 CYP2F1P24903 491 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 RPL22P35268 128 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 BCAR1P56945 870 aa23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
VSTM4-201ENST00000298454 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
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