RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YCR095W-AQ3E787 52 aa6.69□□□□□ -1.34
PRP4YPR178W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRP4YPR178W TOR1P35169 2470 aa6.68□□□□□ -1.34
PRP4YPR178W MMS2P53152 137 aa6.67□□□□□ -1.34
PRP4YPR178W YFR032C-BQ8TGU2 87 aa6.66□□□□□ -1.34
PRP4YPR178W YPR195CQ06594 109 aa6.65□□□□□ -1.35
PRP4YPR178W CUP1-1P0CX80 61 aa6.58□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W CUP1-2P0CX81 61 aa6.58□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W YHR073W-AP0C5N7 58 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W YJR128WP47162 119 aa6.57□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W ATP17Q06405 101 aa6.55□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa6.54□□□□□ -1.36
PRP4YPR178W YLR255CO13574 117 aa6.52□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W LCL1Q02786 101 aa6.52□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W LCL2Q08045 131 aa6.52□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa6.51□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W YML100W-AQ8TGT0 57 aa6.5□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa6.48□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W YOR376W-AQ3E805 51 aa6.48□□□□□ -1.37
PRP4YPR178W COX8P04039 78 aa6.45□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W YGL149WP53116 101 aa6.44□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W YOR316C-AQ3E806 69 aa6.44□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W YBL008W-AQ3E821 79 aa6.44□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W NUM1Q00402 2748 aa6.44□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W YGL034CP53186 121 aa6.44□□□□□ -1.38
PRP4YPR178W DYN1P36022 4092 aa6.39□□□□□ -1.39
PRP4YPR178W MRX7P53869 86 aa6.33□□□□□ -1.4
PRP4YPR178W OLI1P61829 76 aa6.31□□□□□ -1.4
PRP4YPR178W YBR016WP38216 128 aa6.28□□□□□ -1.4
PRP4YPR178W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRP4YPR178W FYV12Q08559 129 aa6.27□□□□□ -1.41
PRP4YPR178W COX7P10174 60 aa6.24□□□□□ -1.41
PRP4YPR178W DDR48P18899 430 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRP4YPR178W YJL144WP47009 104 aa6.2□□□□□ -1.42
PRP4YPR178W YGL014C-AP0C5N1 53 aa6.14□□□□□ -1.43
PRP4YPR178W QCR10P37299 77 aa6.13□□□□□ -1.43
PRP4YPR178W YEL014CP39999 101 aa6.07□□□□□ -1.44
PRP4YPR178W YCR108CQ3E819 63 aa5.95□□□□□ -1.46
PRP4YPR178W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa5.93□□□□□ -1.46
PRP4YPR178W YBL044WP38194 122 aa5.91□□□□□ -1.46
PRP4YPR178W SOM1Q05676 74 aa5.87□□□□□ -1.47
PRP4YPR178W YFL067WP43537 175 aa5.84□□□□□ -1.47
PRP4YPR178W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PRP4YPR178W YDR210WQ03482 75 aa5.64□□□□□ -1.51
PRP4YPR178W CMC4Q3E7A9 73 aa5.64□□□□□ -1.51
PRP4YPR178W Q0017Q9ZZX8 53 aa5.59□□□□□ -1.51
PRP4YPR178W YML054C-AQ3E809 52 aa5.57□□□□□ -1.52
PRP4YPR178W YOR072W-BQ3E832 53 aa5.54□□□□□ -1.52
PRP4YPR178W YJL009WP47078 108 aa5.52□□□□□ -1.53
PRP4YPR178W YBR072C-AQ3E794 53 aa5.43□□□□□ -1.54
PRP4YPR178W HHY1P39982 102 aa5.41□□□□□ -1.54
PRP4YPR178W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
PRP4YPR178W YER175W-AQ8TGU4 54 aa5.09□□□□□ -1.59
PRP4YPR178W YER078W-AQ3E7A2 54 aa5.05□□□□□ -1.6
PRP4YPR178W YHR032W-AP0C5N6 59 aa4.59□□□□□ -1.67
PRP4YPR178W YHR050W-AQ05451 56 aa4.42□□□□□ -1.7
PRP4YPR178W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa4.4□□□□□ -1.7
PRP4YPR178W YAL067W-AQ8TGK6 75 aa4.28□□□□□ -1.72
PRP4YPR178W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PRP4YPR178W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PRP4YPR178W YLR157W-EP0CF00 54 aa3.8□□□□□ -1.8
PRP4YPR178W YHR086W-AQ3E746 53 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.8 ms