RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YKL183C-AQ3E765 70 aa3.15□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C YFL041W-AQ3E817 63 aa3.15□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C OLI1P61829 76 aa3.13□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C YBL044WP38194 122 aa3.12□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C ATX1P38636 73 aa3.12□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C RPL37AP49166 88 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
SPE3YPR069C INO4P13902 151 aa3.08□□□□□ -1.92
SPE3YPR069C YIL102CP40488 101 aa3.08□□□□□ -1.92
SPE3YPR069C YOR314WQ12506 109 aa3.08□□□□□ -1.92
SPE3YPR069C YHR125WP38831 101 aa3.05□□□□□ -1.92
SPE3YPR069C NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SPE3YPR069C YER175W-AQ8TGU4 54 aa3□□□□□ -1.93
SPE3YPR069C MRX7P53869 86 aa2.99□□□□□ -1.93
SPE3YPR069C YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa2.99□□□□□ -1.93
SPE3YPR069C YFR032C-BQ8TGU2 87 aa2.99□□□□□ -1.93
SPE3YPR069C AIM4P38305 123 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
SPE3YPR069C RUB1Q03919 77 aa2.96□□□□□ -1.94
SPE3YPR069C YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa2.95□□□□□ -1.94
SPE3YPR069C YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa2.93□□□□□ -1.94
SPE3YPR069C SLO1Q3E784 85 aa2.91□□□□□ -1.94
SPE3YPR069C YDR246W-AQ3E763 66 aa2.9□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C YFL065CP43539 102 aa2.89□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C YPR203WQ08994 102 aa2.89□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C OST5Q92316 86 aa2.88□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C YDR182W-AQ3E796 67 aa2.87□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C SDH6Q3E785 79 aa2.84□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa2.84□□□□□ -1.95
SPE3YPR069C YPL038W-AQ3E7B4 63 aa2.82□□□□□ -1.96
SPE3YPR069C YDR119W-AQ2V2P9 66 aa2.79□□□□□ -1.96
SPE3YPR069C YMR001C-AQ8TGS9 76 aa2.74□□□□□ -1.97
SPE3YPR069C YIR021W-AQ3E739 70 aa2.72□□□□□ -1.97
SPE3YPR069C HUB1Q6Q546 73 aa2.71□□□□□ -1.98
SPE3YPR069C ATP17Q06405 101 aa2.69□□□□□ -1.98
SPE3YPR069C TOM6P33448 61 aa2.68□□□□□ -1.98
SPE3YPR069C YER188C-AP0C0V2 99 aa2.63□□□□□ -1.99
SPE3YPR069C YMR122CQ03879 124 aa2.6□□□□□ -1.99
SPE3YPR069C SBH1P52870 82 aa2.55□□□□□ -2
SPE3YPR069C YCR108CQ3E819 63 aa2.51□□□□□ -2.01
SPE3YPR069C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SPE3YPR069C YLR412C-AQ3E742 68 aa2.5□□□□□ -2.01
SPE3YPR069C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SPE3YPR069C YOR072W-BQ3E832 53 aa2.49□□□□□ -2.01
SPE3YPR069C YBR121C-AP0C5L4 52 aa2.46□□□□□ -2.02
SPE3YPR069C YOR381W-AQ3E804 55 aa2.4□□□□□ -2.03
SPE3YPR069C YEL014CP39999 101 aa2.37□□□□□ -2.03
SPE3YPR069C YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa2.37□□□□□ -2.03
SPE3YPR069C YER078W-AQ3E7A2 54 aa2.34□□□□□ -2.03
SPE3YPR069C YCR095W-AQ3E787 52 aa2.31□□□□□ -2.04
SPE3YPR069C YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.22□□□□□ -2.05
SPE3YPR069C HHY1P39982 102 aa2.21□□□□□ -2.06
SPE3YPR069C QCR10P37299 77 aa2.2□□□□□ -2.06
SPE3YPR069C YOR376W-AQ3E805 51 aa2.15□□□□□ -2.07
SPE3YPR069C YHR050W-AQ05451 56 aa2.13□□□□□ -2.07
SPE3YPR069C YGL014C-AP0C5N1 53 aa2.1□□□□□ -2.07
SPE3YPR069C YBR072C-AQ3E794 53 aa2.05□□□□□ -2.08
SPE3YPR069C SOM1Q05676 74 aa2.02□□□□□ -2.09
SPE3YPR069C YAL067W-AQ8TGK6 75 aa1.92□□□□□ -2.1
SPE3YPR069C YLR157W-EP0CF00 54 aa1.5□□□□□ -2.17
SPE3YPR069C YHR032W-AP0C5N6 59 aa1.49□□□□□ -2.17
SPE3YPR069C YHR086W-AQ3E746 53 aa1.45□□□□□ -2.18
SPE3YPR069C YOL164W-AQ3E7A5 60 aa1.45□□□□□ -2.18
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