RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	NAT5	Q08689	176 aa		0.23	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	ATP17	Q06405	101 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	OST5	Q92316	86 aa		0.22	□□□□□ -2.37
PAM16	YJL104W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.21	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.2	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	FMP16	Q12497	93 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.19	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.18	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YCR085W	P25650	117 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.18	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YLR157W-E	P0CF00	54 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	HHY1	P39982	102 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	SDH6	Q3E785	79 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.17	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		0.16	□□□□□ -2.38
PAM16	YJL104W	YSY6	P38374	65 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	LSM8	P47093	109 aa	Known RBP	0.15	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	SEN15	Q04675	128 aa		0.15	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	YEL014C	P39999	101 aa		0.14	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	ATX1	P38636	73 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		0.13	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	SAE3	P89114	91 aa		0.12	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	YBR072C-A	Q3E794	53 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	YCR108C	Q3E819	63 aa		0.11	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	RUB1	Q03919	77 aa		0.1	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
PAM16	YJL104W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YFL065C	P43539	102 aa		0.08	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YPR203W	Q08994	102 aa		0.08	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		0.08	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.07	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YNL198C	P40166	100 aa		0.07	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	QCR10	P37299	77 aa		0.06	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.05	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		0.05	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.04	□□□□□ -2.4
PAM16	YJL104W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.01	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	SOM1	Q05676	74 aa		0	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		0	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		0	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	TOM6	P33448	61 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	SLO1	Q3E784	85 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
PAM16	YJL104W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
PAM16	YJL104W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
PAM16	YJL104W	SBH1	P52870	82 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
PAM16	YJL104W	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
PAM16	YJL104W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
PAM16	YJL104W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
PAM16	YJL104W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		-0.33	□□□□□ -2.46
PAM16	YJL104W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		-0.35	□□□□□ -2.47

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