RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SP2	Q02086	613 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	BIRC2	Q13490	618 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MSS51	Q4VC12	460 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM192	Q8IY95	271 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	OXNAD1	Q96HP4	312 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CNPY3	Q9BT09	278 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	DPP3	Q9NY33	737 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ADA2	Q9NZK5	511 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	BFAR	Q9NZS9	450 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		12.21	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	C19orf81	C9J6K1	198 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CRCP	O75575	148 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TPH1	P17752	444 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	AVPR1A	P37288	418 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CASP2	P42575	452 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SULT1E1	P49888	294 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A3	Q00325	362 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA24	Q86W54	205 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	FGD4	Q96M96	766 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR27	A2RRH5	827 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM63A	O94886	807 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LYPLA2	O95372	231 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ASMTL	O95671	621 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	INSRR	P14616	1297 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	IL1R2	P27930	398 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SERPINB5	P36952	375 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKN2B	P42772	138 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGA9	Q13797	1035 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS6KA2	Q15349	733 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	HUS1	O60921	280 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ATP6V1B1	P15313	513 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	AKAP5	P24588	427 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LAYN	Q6UX15	382 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	APOC2	P02655	101 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP2F1	P24903	491 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	BOLA3	Q53S33	107 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MOB2	Q70IA6	237 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM136A	Q96C01	138 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A9	O60656	530 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MTA2	O94776	668 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	USP1	O94782	785 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ERBB2	P04626	1255 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	GNAT1	P11488	350 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	MX2	P20592	715 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TNFAIP2	Q03169	654 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC12A1	Q13621	1099 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	USP54	Q70EL1	1684 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SPIN3-223	ENST00000639525	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46

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