RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	CILP	O75339	1184 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	BEST1	O76090	585 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	SMC2	O95347	1197 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	ADH5	P11766	374 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	MXI1	P50539	228 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	PNKP	Q96T60	521 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		28.58	■■■□□ 2.17
LYNX1-208	ENST00000615007	TLR5	O60602	858 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	APOD	P05090	189 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	CD58	P19256	250 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXC13	P31276	330 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GAB4	Q2WGN9	574 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	USP33	Q8TEY7	942 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	TWNK	Q96RR1	684 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	EBF1	Q9UH73	591 aa		28.57	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GAD2	Q05329	585 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	RTKN	Q9BST9	563 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SCML2	Q9UQR0	700 aa		28.56	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007		K7EQS6	105 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SEC13	P55735	322 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	NETO1	Q8TDF5	533 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	CYLD	Q9NQC7	956 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	RAB20	Q9NX57	234 aa		28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PRCP	P42785	496 aa		28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	C2orf27A	Q580R0	203 aa		28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SMARCE1	Q969G3	411 aa		28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		28.54	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	EPN2	O95208	641 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	KAT7	O95251	611 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GRIA2	P42262	883 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	KBTBD6	Q86V97	674 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	WHAMM	Q8TF30	809 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	TIGD1	Q96MW7	591 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	LSM7	Q9UK45	103 aa	Known RBP	28.53	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	HHLA1	C9JL84	531 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	IRF1	P10914	325 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PSEN1	P49768	467 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	DGKE	P52429	567 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	LRRC63	Q05C16	580 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	ELF2	Q15723	593 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	C11orf74	Q86VG3	221 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	DUSP16	Q9BY84	665 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		28.52	■■■□□ 2.16
LYNX1-208	ENST00000615007	CYP26A1	O43174	497 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	TNFRSF4	P43489	277 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC6A11	P48066	632 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	STIM1	Q13586	685 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF394	Q53GI3	561 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	SPATA20	Q8TB22	786 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	CISH	Q9NSE2	258 aa		28.51	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A0A0MRY4	1105 aa		28.5	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	ALDH1A2	O94788	518 aa		28.5	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	RHOBTB1	O94844	696 aa		28.5	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC8A3	P57103	927 aa		28.5	■■■□□ 2.15
LYNX1-208	ENST00000615007	HTR3D	Q70Z44	454 aa		28.5	■■■□□ 2.15

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