RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 DCAF6Q58WW2 860 aa20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 ZWILCHQ9H900 591 aa20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 TRIM66O15016 1216 aa20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 POLNQ7Z5Q5 900 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 EXD1Q8NHP7 514 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 GPR152Q8TDT2 470 aa20.61■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.6■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PGS1-211ENST00000589425 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.59■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.59■□□□□ 0.89
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PGS1-211ENST00000589425 SULT1E1P49888 294 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MFSD7Q6UXD7 560 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 BNIPLQ7Z465 357 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 ZBP1Q9H171 429 aa20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.57■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 PRPSAP2O60256 369 aa20.57■□□□□ 0.88
PGS1-211ENST00000589425 ENDOD1O94919 500 aa20.57■□□□□ 0.88
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