RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RRM1P23921 792 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PPM1AP35813 382 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIK1P39086 918 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP25P42331 645 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GPD2P43304 727 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MAGEA1P43355 309 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BPIFB4P59827 614 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCLQ13371 301 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GRIN2CQ14957 1233 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF5Q15542 800 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC18A3Q16572 532 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DBN1Q16643 649 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAT5BQ3V5L5 792 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ACAD10Q6JQN1 1059 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TRNP1Q6NT89 227 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MON1BQ7L1V2 547 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1328Q86T90 577 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EMC1Q8N766 993 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35F5Q8WV83 523 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF653Q96CK0 615 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAXDC2Q96IV6 333 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TNIP3Q96KP6 325 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM81BQ96LP2 452 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DUSP16Q9BY84 665 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFLR1Q9H665 355 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4F11Q9HBI6 524 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR9Q9NR96 1032 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HESX1Q9UBX0 185 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PATJQ8NI35 1801 aa6.36□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GNB5O14775 395 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL16O15467 120 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MED7O43513 233 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TGM5O43548 720 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RTN2O75298 545 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RFPL2O75678 378 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MOCS3O95396 460 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM163BP0C2L3 166 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC172P0C7W6 258 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GJA1P17302 382 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NPR3P17342 541 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRC2P26717 231 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 COL8A1P27658 744 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 NRIP1P48552 1158 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TKTL1P51854 596 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 VAV2P52735 878 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BCAT1P54687 386 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OGDHQ02218 1023 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPCQ03188 943 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ADIGQ0VDE8 80 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR17Q13304 367 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 PLD1Q13393 1074 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB33AQ14088 237 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 ADGRE1Q14246 886 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SPA17Q15506 151 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 Q7L0L9 218 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MCOLN2Q8IZK6 566 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC39CQ8N584 583 aa6.35□□□□□ -1.39
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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