RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM240	Q5SV17	173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	FGF2	P09038	288 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	HSF1	Q00613	529 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	NLRP4	Q96MN2	994 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
COPS2-205	ENST00000558843	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	SLC28A2	O43868	658 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ALDH2	P05091	517 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CREB1	P16220	341 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CPA2	P48052	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ZXDB	P98169	803 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CFHR3	Q02985	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	STIM1	Q13586	685 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		4.52	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	EPHA3	P29320	983 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TACR3	P29371	465 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MTHFS	P49914	203 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	RAB1A	P62820	205 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	IGBP1	P78318	339 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CTBP1	Q13363	440 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ASB5	Q8WWX0	329 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.51	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CLIC1	O00299	241 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	NPR1	P16066	1061 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	VCAM1	P19320	739 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	ARFIP2	P53365	341 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TIRAP	P58753	221 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.5	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	BTN3A1	O00481	513 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	NGFR	P08138	427 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	AKAP5	P24588	427 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	UQCRC1	P31930	480 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	NEK2	P51955	445 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	FGL2	Q14314	439 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	HOOK2	Q96ED9	719 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		4.49	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.48	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	INPPL1	O15357	1258 aa		4.48	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	PF4V1	P10720	104 aa		4.48	□□□□□ -1.69
COPS2-205	ENST00000558843	MCM5	P33992	734 aa		4.48	□□□□□ -1.69

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