RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DACT1	Q9NYF0	836 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089		F5H697	171 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CCP110	O43303	1012 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SH3BP5	O60239	455 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SOAT2	O75908	522 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PIAS2	O75928	621 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KCNA2	P16389	499 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FGFR4	P22455	802 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LRPAP1	P30533	357 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RENBP	P51606	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RABGGTB	P53611	331 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	COPA	P53621	1224 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LOXL3	P58215	753 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RAB30	Q15771	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZRM9	215 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MED15	Q96RN5	788 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	DCLK1	O15075	740 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF185	O15231	689 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TLR5	O60602	858 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF623	O75123	536 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	COQ9	O75208	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	A1BG	P04217	495 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRKG1	Q13976	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	E2F2	Q14209	437 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089		Q8TCH9	128 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RUBCN	Q92622	972 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM38	O00635	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	ATIC	P31939	592 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	NDUFV1	P49821	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MDM2-223	ENST00000536089	SCNN1G	P51170	649 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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