RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 DUSP26Q9BV47 211 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 SARGQ9BW04 601 aa4.63□□□□□ -1.67
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CLVS1-209ENST00000522928 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 METP08581 1390 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 NALCNQ8IZF0 1738 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 DCCP43146 1447 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 VPS8Q8N3P4 1428 aa4.63□□□□□ -1.67
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa4.63□□□□□ -1.67
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CLVS1-209ENST00000522928 H7C4K7 107 aa4.61□□□□□ -1.67
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CLVS1-209ENST00000522928 FESP07332 822 aa4.61□□□□□ -1.67
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CLVS1-209ENST00000522928 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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CLVS1-209ENST00000522928 STK26Q9P289 416 aa4.6□□□□□ -1.67
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