RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPEF1Q9Y4P9 236 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLIC1O00299 241 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTN3A1O00481 513 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBC1D4O60343 1298 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB1AP62820 205 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSF1Q00613 529 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC14A1Q13336 389 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MANEAQ5SRI9 462 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM240Q5SV17 173 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCAF12L1Q5VU92 463 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP43Q70EL4 1123 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC25A28Q96A46 364 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PPL8 197 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM233B4DJY2 109 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 INPPL1O15357 1258 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPRY2O43597 315 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD63P08962 238 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKAP5P24588 427 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CFHR3Q02985 330 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC13A2Q13183 592 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB32Q13637 225 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRTGQ2VWP7 1150 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF628Q5EBL2 1059 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 LINC01465Q8N7H1 131 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 USP29Q9HBJ7 922 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 C4orf47A7E2U8 309 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 AP1G1O43747 822 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 OFD1O75665 1012 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCAM1P19320 739 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 UQCRC1P31930 480 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ITGA8P53708 1063 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAAM2Q86T65 1068 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HPS3Q969F9 1004 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIC2Q96JB3 615 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDFICQ9P1T7 246 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOC5O00471 708 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FYB1O15117 783 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NGFRP08138 427 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 KITP10721 976 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 NPR1P16066 1061 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 MT3P25713 68 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIRAPP58753 221 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZXDBP98169 803 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASIC2Q16515 512 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 INSCQ1MX18 579 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM110CQ1W6H9 321 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASB5Q8WWX0 329 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A088AWK7 358 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 C2CD4BA6NLJ0 364 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRT86O43790 486 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC28A2O43868 658 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 RASSF9O75901 435 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HGFP14210 728 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFRSF1BP20333 461 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 HTR1BP28222 390 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATMP50440 423 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PGDP52209 483 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 B4GALNT1Q00973 533 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 AMPD3Q01432 767 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPATQ06203 517 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms