RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS41	P49754	854 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPC3	Q13507	836 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MTMR3	Q13615	1198 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SURF1	Q15526	300 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CCNG2	Q16589	344 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TAZ	Q16635	292 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT71	Q3SY84	523 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TDH	Q8IZJ6	230 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	EXD1	Q8NHP7	514 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	UBA3	Q8TBC4	463 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HLA-C	Q95604	372 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RUFY1	Q96T51	708 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	LHX5	Q9H2C1	402 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CENPH	Q9H3R5	247 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	WHRN	Q9P202	907 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		6.1	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1B0GUA9	196 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SMIM23	A6NLE4	172 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PIK3R2	O00459	728 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	LRCH4	O75427	683 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	BANF1	O75531	89 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	NPTXR	O95502	500 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CXCL10	P02778	98 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CALB1	P05937	261 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PAEP	P09466	180 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MYZAP	P0CAP1	466 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	FGFR1	P11362	822 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	RARG	P13631	454 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CD19	P15391	556 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	DRD4	P21917	467 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GCA	P28676	217 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN7	P35236	360 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GRM5	P41594	1212 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SLCO1A2	P46721	670 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GABRB2	P47870	512 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ARSE	P51690	589 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	NDST1	P52848	882 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	NRL	P54845	237 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GDF10	P55107	478 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP2R2A	P63151	447 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	MPP2	Q14168	576 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R7	Q15435	360 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SKIV2L	Q15477	1246 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CLUL1	Q15846	466 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB6	Q15916	424 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	KYNU	Q16719	465 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CCDC38	Q502W7	563 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	UBXN11	Q5T124	520 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	KAZN	Q674X7	775 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	VSTM1	Q6UX27	236 aa		6.09	□□□□□ -1.43
C4BPB-208	ENST00000492730	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		6.09	□□□□□ -1.43

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