RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482083.7

RNF13-213, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-213	ENST00000482083	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	BTN3A1	O00481	513 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	NPR1	P16066	1061 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	UQCRC1	P31930	480 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	EVA1C	P58658	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	KAZALD1	Q96I82	304 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		4.15	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083		H3BML4	177 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	FGF2	P09038	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TACR3	P29371	465 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	RAB32	Q13637	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083		A8MVJ9	347 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CCP110	O43303	1012 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	OFD1	O75665	1012 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	MTHFS	P49914	203 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	INSC	Q1MX18	579 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083		Q6ZTC4	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CLIC1	O00299	241 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	YPEL5	P62699	121 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	HYAL1	Q12794	435 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	STIM1	Q13586	685 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083		A0A1W2PPL8	197 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CD63	P08962	238 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	HTR1B	P28222	390 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	MCM5	P33992	734 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	CPA2	P48052	419 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	LACTBL1	A8MY62	500 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	EXOC5	O00471	708 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	INPPL1	O15357	1258 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	AKAP10	O43572	662 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	UBXN7	O94888	489 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RNF13-213	ENST00000482083	TGFB3	P10600	412 aa		4.11	□□□□□ -1.75

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