RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442707.1

KIAA1109-208, Transcript of KIAA1109, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KIAA1109, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1109-208ENST00000442707 MTMR9Q96QG7 549 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 IL25Q9H293 177 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 GAREM1Q9H706 876 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 PTPRHQ9HD43 1115 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ABCB6Q9NP58 842 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 VPS54Q9P1Q0 977 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 KLF15Q9UIH9 416 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HCN2Q9UL51 889 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 STARD13Q9Y3M8 1113 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 STK36Q9NRP7 1315 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 BPTFQ12830 3046 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.13□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 VWA8A3KMH1 1905 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 M0R2N6 131 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CLDN3O15551 220 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SLC28A2O43868 658 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 USO1O60763 962 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 TOM1L1O75674 476 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CDKL5O76039 1030 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CYP11A1P05108 521 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CLTAP09496 248 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ARAFP10398 606 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 PSMA5P28066 241 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CD6P30203 668 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ABCD1P33897 745 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SMTNP53814 917 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SEC13P55735 322 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CYP4F8P98187 520 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 TSPY1Q01534 308 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 GAD2Q05329 585 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 GRIK2Q13002 908 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 STRN3Q13033 797 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 KCNB1Q14721 858 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZNF77Q15935 545 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HLA-BQ31612 363 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 TXNDC8Q6A555 127 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 MAEAQ7L5Y9 396 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ALLCQ8N6M5 410 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 WASF1Q92558 559 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HAS1Q92839 578 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 TIPINQ9BVW5 301 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 DPH1Q9BZG8 443 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 GPRC5CQ9NQ84 441 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 DEC1Q9P2X7 70 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.12□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 COL4A2P08572 1712 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CCDC169A6NNP5 214 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 MEI4A8MW99 385 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SGK1O00141 431 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 YKT6O15498 198 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SLC37A4O43826 429 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CILPO75339 1184 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 LARGE1O95461 756 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 GP1BBP13224 206 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ITPKBP27987 946 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 ADSSP30520 456 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 OPRD1P41143 372 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 EVCP57679 992 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 LILRA4P59901 499 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 OSTNP61366 133 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 CXADRP78310 365 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 E2F1Q01094 437 aa6.11□□□□□ -1.43
KIAA1109-208ENST00000442707 SEMG2Q02383 582 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms