RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.75■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 PRAM1Q96QH2 718 aa29.74■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRB1O14514 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 DLC1Q96QB1 1528 aa29.73■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 NEUROD1Q13562 356 aa29.73■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.72■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.72■■■□□ 2.35
CIRBP-211ENST00000586773 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.69■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 ORAI2Q96SN7 254 aa29.69■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.68■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.68■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.66■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa29.66■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2FA1L443 756 aa29.64■■■□□ 2.34
CIRBP-211ENST00000586773 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
CIRBP-211ENST00000586773 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.61■■■□□ 2.33
CIRBP-211ENST00000586773 SHPRHQ149N8 1683 aa29.6■■■□□ 2.33
CIRBP-211ENST00000586773 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.6■■■□□ 2.33
CIRBP-211ENST00000586773 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 ILDR2Q71H61 639 aa29.56■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.55■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 FOXO3O43524 673 aa29.54■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 ADGRB2O60241 1585 aa29.54■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 TONSLQ96HA7 1378 aa29.52■■■□□ 2.32
CIRBP-211ENST00000586773 KIF1AQ12756 1690 aa29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.51■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.5■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.49■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 PSME1Q06323 249 aa29.46■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 PCGF6Q9BYE7 350 aa29.46■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CIRBP-211ENST00000586773 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.44■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 LRP6O75581 1613 aa29.44■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.44■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 PXDNQ92626 1479 aa29.43■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.42■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.4■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 USP32Q8NFA0 1604 aa29.39■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 CDK19Q9BWU1 502 aa29.39■■■□□ 2.3
CIRBP-211ENST00000586773 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.36■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.36■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.36■■■□□ 2.29
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CIRBP-211ENST00000586773 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.35■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CIRBP-211ENST00000586773 ITSN1Q15811 1721 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 SBNO1A3KN83 1393 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 ADAMTS2O95450 1211 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 POTEAQ6S8J7 498 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 C8orf37Q96NL8 207 aa29.32■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 NGLY1Q96IV0 654 aa29.3■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.3■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.3■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.3■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.29■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.29■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 ATP7BP35670 1465 aa29.29■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 AFF2P51816 1311 aa29.28■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGEF10O15013 1369 aa29.27■■■□□ 2.28
CIRBP-211ENST00000586773 EVC2Q86UK5 1308 aa29.26■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.25■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.22■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 CABP2Q9NPB3 220 aa29.22■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CIRBP-211ENST00000586773 ACEP12821 1306 aa29.19■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.18■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 RXRBP28702 533 aa29.18■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 USP21Q9UK80 565 aa29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 PLEKHG5O94827 1062 aa29.15■■■□□ 2.26
CIRBP-211ENST00000586773 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.14■■■□□ 2.26
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