RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516524.1

RNU6-964P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 964, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-964P, Length 69 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-964P-201ENST00000516524 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-964P-201ENST00000516524 JPH4Q96JJ6 628 aa9.65□□□□□ -0.86
RNU6-964P-201ENST00000516524 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RNU6-964P-201ENST00000516524 NDUFV2P19404 249 aa9.64□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAM196BA6NMK8 535 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 ITGAEP38570 1179 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.63□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 RCCD1A6NED2 376 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 GPR37L1O60883 481 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 KDM4AO75164 1064 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 PRSS12P56730 875 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 IER5LQ5T953 404 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.62□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZNF592Q92610 1267 aa9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 FDX1P10109 184 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 COL19A1Q14993 1142 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 STK32AQ8WU08 396 aa9.6□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKRD62A6NC57 917 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 DNAJB2P25686 324 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.59□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RNU6-964P-201ENST00000516524 MTMR2Q13614 643 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 SLF2Q8IX21 1173 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.58□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.57□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATP2B4P23634 1241 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.56□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L3A6NCW0 530 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L4A6NCW7 530 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 PLCG2P16885 1265 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 RNF135Q8IUD6 432 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 RDH13Q8NBN7 331 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 TSC1Q92574 1164 aa9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L15C9J2P7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L10C9JJH3 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L12C9JPN9 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L11C9JVI0 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L21D6R901 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L18D6R9N7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L22D6RA61 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L19D6RCP7 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L20D6RJB6 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 HOXA2O43364 376 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L24Q0WX57 530 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 NR1H3Q13133 447 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 EYA1Q99502 592 aa9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 FGD1P98174 961 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.53□□□□□ -0.88
RNU6-964P-201ENST00000516524 SERPINB4P48594 390 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.52□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 USP17L5A8MUK1 530 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 RECKO95980 971 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 SKIP12755 728 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 FOSBP53539 338 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 ASB16Q96NS5 453 aa9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 NBPF26B4DH59 902 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 RASA1P20936 1047 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 BRD2P25440 801 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 CLCN6P51797 869 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 GCGRP47871 477 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.49□□□□□ -0.89
RNU6-964P-201ENST00000516524 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms