RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476675.5

PRKCE-208, Transcript of protein kinase C epsilon, human

TSL 4

Gene PRKCE, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCE-208	ENST00000476675	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PRKCE-208	ENST00000476675	ORAI2	Q96SN7	254 aa		29.41	■■■□□ 2.3
PRKCE-208	ENST00000476675	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
PRKCE-208	ENST00000476675	ADGRB1	O14514	1584 aa		29.39	■■■□□ 2.29
PRKCE-208	ENST00000476675	LRP6	O75581	1613 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PRKCE-208	ENST00000476675	SHPRH	Q149N8	1683 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PRKCE-208	ENST00000476675	NUTM2F	A1L443	756 aa		29.35	■■■□□ 2.29
PRKCE-208	ENST00000476675	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	29.33	■■■□□ 2.29
PRKCE-208	ENST00000476675	PRAM1	Q96QH2	718 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	SOCS7	O14512	581 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	SIRT1	Q96EB6	747 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	DLC1	Q96QB1	1528 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PRKCE-208	ENST00000476675	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	POTEA	Q6S8J7	498 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	STAC3	Q96MF2	364 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	POGK	Q9P215	609 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PRKCE-208	ENST00000476675	PXDN	Q92626	1479 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	FOXO3	O43524	673 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	ADGRB2	O60241	1585 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	NEUROD1	Q13562	356 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	USP32	Q8NFA0	1604 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PRKCE-208	ENST00000476675	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRKCE-208	ENST00000476675	KIF1A	Q12756	1690 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRKCE-208	ENST00000476675	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRKCE-208	ENST00000476675	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRKCE-208	ENST00000476675	ADAMTS2	O95450	1211 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	AFF2	P51816	1311 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	C8orf37	Q96NL8	207 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCE-208	ENST00000476675	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PRKCE-208	ENST00000476675	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PRKCE-208	ENST00000476675	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRKCE-208	ENST00000476675	ATP7B	P35670	1465 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PRKCE-208	ENST00000476675	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	PLEKHG5	O94827	1062 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	NGLY1	Q96IV0	654 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	PSME1	Q06323	249 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	CDK19	Q9BWU1	502 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	SBNO1	A3KN83	1393 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRKCE-208	ENST00000476675	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	ITSN1	Q15811	1721 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	RXRB	P28702	533 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	ABCA3	Q99758	1704 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	USP21	Q9UK80	565 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	TONSL	Q96HA7	1378 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	ALS2	Q96Q42	1657 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCE-208	ENST00000476675	ARHGEF10	O15013	1369 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	RGS12	O14924	1447 aa		28.78	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	ACE	P12821	1306 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	ATRN	O75882	1429 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PRKCE-208	ENST00000476675	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		28.74	■■■□□ 2.19
PRKCE-208	ENST00000476675	SLIT2	O94813	1529 aa		28.74	■■■□□ 2.19

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