RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 BRINP3Q76B58 766 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 NEUROD1Q13562 356 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 PRAM1Q96QH2 718 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP1-205ENST00000466097 POGKQ9P215 609 aa21.27■■□□□ 1
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SH3BP1-205ENST00000466097 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 JCADQ9P266 1359 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
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SH3BP1-205ENST00000466097 ADGRB2O60241 1585 aa21.23■□□□□ 0.99
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SH3BP1-205ENST00000466097 NUTM2FA1L443 756 aa21.18■□□□□ 0.98
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SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 NGLY1Q96IV0 654 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 ACEP12821 1306 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SH3BP1-205ENST00000466097 ATAD2Q6PL18 1390 aa20.84■□□□□ 0.93
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SH3BP1-205ENST00000466097 AKAP12Q02952 1782 aa20.82■□□□□ 0.92
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