RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459627.1

SH3BP5-208, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 473 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-208ENST00000459627 NUTM2FA1L443 756 aa34.79■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.79■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 JCADQ9P266 1359 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.77■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRB1O14514 1584 aa34.76■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
SH3BP5-208ENST00000459627 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34.75■■■■□ 3.15
SH3BP5-208ENST00000459627 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.74■■■■□ 3.15
SH3BP5-208ENST00000459627 PRAM1Q96QH2 718 aa34.74■■■■□ 3.15
SH3BP5-208ENST00000459627 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.74■■■■□ 3.15
SH3BP5-208ENST00000459627 NEUROD1Q13562 356 aa34.69■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SIRT1Q96EB6 747 aa34.69■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.68■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 STAC3Q96MF2 364 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 POGKQ9P215 609 aa34.67■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 SHPRHQ149N8 1683 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 LRP6O75581 1613 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 DLC1Q96QB1 1528 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.64■■■■□ 3.14
SH3BP5-208ENST00000459627 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
SH3BP5-208ENST00000459627 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
SH3BP5-208ENST00000459627 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
SH3BP5-208ENST00000459627 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.61■■■■□ 3.13
SH3BP5-208ENST00000459627 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
SH3BP5-208ENST00000459627 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.57■■■■□ 3.13
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SH3BP5-208ENST00000459627 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
SH3BP5-208ENST00000459627 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
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SH3BP5-208ENST00000459627 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SH3BP5-208ENST00000459627 POTEAQ6S8J7 498 aa34.51■■■■□ 3.12
SH3BP5-208ENST00000459627 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa34.5■■■■□ 3.11
SH3BP5-208ENST00000459627 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.49■■■■□ 3.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PXDNQ92626 1479 aa34.47■■■■□ 3.11
SH3BP5-208ENST00000459627 ADGRB2O60241 1585 aa34.46■■■■□ 3.11
SH3BP5-208ENST00000459627 USP32Q8NFA0 1604 aa34.46■■■■□ 3.11
SH3BP5-208ENST00000459627 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.44■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 KIF1AQ12756 1690 aa34.41■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.41■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 ADAMTS2O95450 1211 aa34.39■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.39■■■■□ 3.1
SH3BP5-208ENST00000459627 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.36■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.35■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.35■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 C8orf37Q96NL8 207 aa34.35■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 AFF2P51816 1311 aa34.32■■■■□ 3.09
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHG5O94827 1062 aa34.32■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 CDK19Q9BWU1 502 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.3■■■■□ 3.08
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SH3BP5-208ENST00000459627 TONSLQ96HA7 1378 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.27■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
SH3BP5-208ENST00000459627 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
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SH3BP5-208ENST00000459627 ATP7BP35670 1465 aa34.25■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 NGLY1Q96IV0 654 aa34.24■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.22■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.21■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
SH3BP5-208ENST00000459627 SBNO1A3KN83 1393 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP5-208ENST00000459627 CABP2Q9NPB3 220 aa34.17■■■■□ 3.06
SH3BP5-208ENST00000459627 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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SH3BP5-208ENST00000459627 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.15■■■■□ 3.06
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SH3BP5-208ENST00000459627 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
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SH3BP5-208ENST00000459627 RXRBP28702 533 aa34.11■■■■□ 3.05
SH3BP5-208ENST00000459627 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
SH3BP5-208ENST00000459627 USP21Q9UK80 565 aa34.11■■■■□ 3.05
SH3BP5-208ENST00000459627 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.1■■■■□ 3.05
SH3BP5-208ENST00000459627 CCDC61Q9Y6R9 512 aa34.09■■■■□ 3.05
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SH3BP5-208ENST00000459627 ARHGEF10O15013 1369 aa34.08■■■■□ 3.05
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SH3BP5-208ENST00000459627 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
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SH3BP5-208ENST00000459627 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa34.04■■■■□ 3.04
SH3BP5-208ENST00000459627 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.03■■■■□ 3.04
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SH3BP5-208ENST00000459627 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP34.01■■■■□ 3.04
SH3BP5-208ENST00000459627 EVC2Q86UK5 1308 aa34.01■■■■□ 3.03
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