RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 SIRT1Q96EB6 747 aa30.71■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.7■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 DCAF11Q8TEB1 546 aa30.7■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
LTB-211ENST00000446745 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.68■■■□□ 2.5
LTB-211ENST00000446745 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
LTB-211ENST00000446745 ORAI2Q96SN7 254 aa30.63■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30.62■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 ESCO1Q5FWF5 840 aa30.61■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 DLC1Q96QB1 1528 aa30.6■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 POGKQ9P215 609 aa30.59■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 LRP6O75581 1613 aa30.58■■■□□ 2.49
LTB-211ENST00000446745 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 FMN2Q9NZ56 1722 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 PRAM1Q96QH2 718 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 ADGRB1O14514 1584 aa30.57■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.56■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.54■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 NUTM2FA1L443 756 aa30.52■■■□□ 2.48
LTB-211ENST00000446745 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 TRAK1Q9UPV9 953 aa30.51■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 KIF1AQ12756 1690 aa30.51■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 POTEAQ6S8J7 498 aa30.49■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 FOXO3O43524 673 aa30.47■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa30.46■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 ADGRB2O60241 1585 aa30.45■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
LTB-211ENST00000446745 PXDNQ92626 1479 aa30.44■■■□□ 2.46
LTB-211ENST00000446745 ANKARQ7Z5J8 1434 aa30.42■■■□□ 2.46
LTB-211ENST00000446745 PHF8Q9UPP1 1060 aa30.41■■■□□ 2.46
LTB-211ENST00000446745 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
LTB-211ENST00000446745 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
LTB-211ENST00000446745 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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LTB-211ENST00000446745 AFF2P51816 1311 aa30.38■■■□□ 2.45
LTB-211ENST00000446745 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
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LTB-211ENST00000446745 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
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LTB-211ENST00000446745 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.34■■■□□ 2.45
LTB-211ENST00000446745 NGLY1Q96IV0 654 aa30.34■■■□□ 2.45
LTB-211ENST00000446745 WASLO00401 505 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
LTB-211ENST00000446745 TULP4Q9NRJ4 1543 aa30.32■■■□□ 2.44
LTB-211ENST00000446745 USP32Q8NFA0 1604 aa30.3■■■□□ 2.44
LTB-211ENST00000446745 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa30.3■■■□□ 2.44
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LTB-211ENST00000446745 NEUROD1Q13562 356 aa30.3■■■□□ 2.44
LTB-211ENST00000446745 L3MBTL2Q969R5 705 aa30.3■■■□□ 2.44
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LTB-211ENST00000446745 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.27■■■□□ 2.44
LTB-211ENST00000446745 SBNO1A3KN83 1393 aa30.26■■■□□ 2.43
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LTB-211ENST00000446745 PRR36Q9H6K5 1346 aa30.21■■■□□ 2.43
LTB-211ENST00000446745 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
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LTB-211ENST00000446745 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
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LTB-211ENST00000446745 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
LTB-211ENST00000446745 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.17■■■□□ 2.42
LTB-211ENST00000446745 ATP7BP35670 1465 aa30.16■■■□□ 2.42
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LTB-211ENST00000446745 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
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LTB-211ENST00000446745 PLEKHG5O94827 1062 aa30.07■■■□□ 2.4
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LTB-211ENST00000446745 ABCA3Q99758 1704 aa30.07■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.06■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 RGS12O14924 1447 aa30.05■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.03■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 SLIT2O94813 1529 aa30.02■■■□□ 2.4
LTB-211ENST00000446745 PLEKHG3A1L390 1219 aa30.02■■■□□ 2.4
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