RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429254.1

LNCPRESS1-201, Transcript of lncRNA p53 regulated and ESC associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LNCPRESS1, Length 756 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.39■■□□□ 1.18
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DLC1Q96QB1 1528 aa22.37■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.37■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.36■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 BRINP3Q76B58 766 aa22.35■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.34■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.34■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.34■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.34■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PRAM1Q96QH2 718 aa22.33■■□□□ 1.17
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SIRT1Q96EB6 747 aa22.32■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.3■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 POGKQ9P215 609 aa22.29■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.27■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUTM2FA1L443 756 aa22.27■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.27■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ORAI2Q96SN7 254 aa22.27■■□□□ 1.16
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ADGRB2O60241 1585 aa22.26■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TONSLQ96HA7 1378 aa22.25■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SHPRHQ149N8 1683 aa22.23■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 JCADQ9P266 1359 aa22.22■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 USP32Q8NFA0 1604 aa22.21■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.21■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KIF1AQ12756 1690 aa22.2■■□□□ 1.15
LNCPRESS1-201ENST00000429254 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.18■■□□□ 1.14
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.17■■□□□ 1.14
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.16■■□□□ 1.14
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.14■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PXDNQ92626 1479 aa22.13■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ITSN1Q15811 1721 aa22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 FOXO3O43524 673 aa22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LRP6O75581 1613 aa22.12■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.1■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.1■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.09■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.09■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.09■■□□□ 1.13
LNCPRESS1-201ENST00000429254 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.08■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ATP7BP35670 1465 aa22.08■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.07■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.06■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.06■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CDK19Q9BWU1 502 aa22.05■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ILDR2Q71H61 639 aa22.03■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.03■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.02■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LNCPRESS1-201ENST00000429254 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PSME1Q06323 249 aa21.99■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.98■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.98■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CABP2Q9NPB3 220 aa21.97■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ALS2Q96Q42 1657 aa21.96■■□□□ 1.11
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ABCA3Q99758 1704 aa21.95■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.94■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.94■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 EVC2Q86UK5 1308 aa21.94■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SBNO1A3KN83 1393 aa21.94■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ADAMTS2O95450 1211 aa21.93■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.93■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.92■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 C8orf37Q96NL8 207 aa21.92■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.91■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ACEP12821 1306 aa21.9■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PLEKHG5O94827 1062 aa21.9■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 POTEAQ6S8J7 498 aa21.9■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 ARHGEF10O15013 1369 aa21.89■■□□□ 1.1
LNCPRESS1-201ENST00000429254 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.89■■□□□ 1.09
LNCPRESS1-201ENST00000429254 AFF2P51816 1311 aa21.88■■□□□ 1.09
LNCPRESS1-201ENST00000429254 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.88■■□□□ 1.09
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