RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIRT1Q96EB6 747 aa23.54■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POGKQ9P215 609 aa23.54■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NHSL1Q5SYE7 1610 aa23.54■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa23.52■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ORAI2Q96SN7 254 aa23.52■■□□□ 1.36
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.51■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAM1Q96QH2 718 aa23.51■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2FA1L443 756 aa23.5■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SHPRHQ149N8 1683 aa23.5■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.49■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DLC1Q96QB1 1528 aa23.48■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOCS7O14512 581 aa23.47■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRB1O14514 1584 aa23.47■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.46■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.43■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEUROD1Q13562 356 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRP6O75581 1613 aa23.41■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXO3O43524 673 aa23.4■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF1AQ12756 1690 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.38■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.37■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADGRB2O60241 1585 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.35■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.34■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.33■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POTEAQ6S8J7 498 aa23.33■■□□□ 1.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PXDNQ92626 1479 aa23.32■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSME1Q06323 249 aa23.31■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C8orf37Q96NL8 207 aa23.31■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WASLO00401 505 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTS2O95450 1211 aa23.3■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.3■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AFF2P51816 1311 aa23.28■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TULP4Q9NRJ4 1543 aa23.28■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.27■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NGLY1Q96IV0 654 aa23.27■■□□□ 1.32
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TONSLQ96HA7 1378 aa23.25■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP32Q8NFA0 1604 aa23.24■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.24■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.24■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.24■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.22■■□□□ 1.31
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SBNO1A3KN83 1393 aa23.2■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.2■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RXRBP28702 533 aa23.2■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK19Q9BWU1 502 aa23.2■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITSN1Q15811 1721 aa23.19■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.19■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGEF10O15013 1369 aa23.19■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHG5O94827 1062 aa23.18■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP21Q9UK80 565 aa23.17■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP7BP35670 1465 aa23.16■■□□□ 1.3
CDH23-AS1-201ENST00000428918 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23.14■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.14■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.09■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.09■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.09■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EVC2Q86UK5 1308 aa23.08■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CABP2Q9NPB3 220 aa23.08■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACEP12821 1306 aa23.07■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.06■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.06■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.05■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.05■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.04■■□□□ 1.28
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALS2Q96Q42 1657 aa23.03■■□□□ 1.28
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