RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 NGEFQ8N5V2 710 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 FSD2A1L4K1 749 aa20.3■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 ERICH4A6NGS2 130 aa20.29■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 MLECQ14165 292 aa20.28■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.27■□□□□ 0.84
PACS1-201ENST00000320580 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.27■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 KIF3BO15066 747 aa20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 MCM5P33992 734 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 AFAP1Q8N556 730 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 SPC24Q8NBT2 197 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 KCNJ4P48050 445 aa20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 VGLL3A8MV65 326 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 TRERF1Q96PN7 1200 aa20.24■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 CDC45O75419 566 aa20.23■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 ERBB4Q15303 1308 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 RABEP1Q15276 862 aa20.22■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 FAM177BA6PVY3 158 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 PTPRKQ15262 1439 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 NPHP1O15259 732 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 TERF1P54274 439 aa20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACS1-201ENST00000320580 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 RUNDC1Q96C34 613 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 TEX35Q5T0J7 233 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.2■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 ARHGEF11O15085 1522 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 REC8O95072 547 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 DISP1Q96F81 1524 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.19■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 NUP160Q12769 1436 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 KIF20AO95235 890 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 HS1BP3Q53T59 392 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 APPP05067 770 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.17■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 CEP170Q5SW79 1584 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 USP25Q9UHP3 1055 aa20.16■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0556O60303 1618 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 TSC1Q92574 1164 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.15■□□□□ 0.82
PACS1-201ENST00000320580 TPM3P06753 285 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 NEK4P51957 841 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.14■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 GPS2Q13227 327 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 CHD1LQ86WJ1 897 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 WWC1Q8IX03 1113 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.13■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 ATP10BO94823 1461 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.12■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RBSNQ9H1K0 784 aa20.11■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RILPL2Q969X0 211 aa20.1■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 RIPK4P57078 832 aa20.09■□□□□ 0.81
PACS1-201ENST00000320580 DMTNQ08495 405 aa20.09■□□□□ 0.81
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