RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W YAL064WP39711 94 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W YOR314WQ12506 109 aa7.33□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W BET1P22804 142 aa7.32□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W ICS3P47034 131 aa7.31□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W SGF11Q03067 99 aa7.31□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W YBR230W-AQ3E762 66 aa7.3□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W KTI11Q3E840 82 aa7.3□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W STF1P01098 86 aa7.29□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W YJL127C-BQ3E828 52 aa7.29□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PRP4YPR178W COX23P38824 151 aa7.27□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YBR121C-AP0C5L4 52 aa7.26□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W IGD1P43598 195 aa7.26□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YDR182W-AQ3E796 67 aa7.26□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W SPC1P46965 94 aa7.25□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YLR307C-AQ3E825 87 aa7.24□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YDR115WQ04598 105 aa7.23□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YOL014WQ08110 124 aa7.23□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa7.23□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W DIF1O13577 133 aa7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W YGR035W-AQ45U48 73 aa7.22□□□□□ -1.25
PRP4YPR178W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W RPL43BP0CX26 92 aa7.2□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W KSH1Q8TGJ3 72 aa7.2□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W YGR164WP53291 111 aa7.2□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W YLR412C-AQ3E742 68 aa7.19□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa7.19□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa7.18□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W TDA8Q6B2U8 126 aa7.18□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W Q0032Q9ZZX7 96 aa7.18□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa7.17□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W RTC6O14464 93 aa7.15□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W SAP30P38429 201 aa7.15□□□□□ -1.26
PRP4YPR178W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W YHL005CP38752 130 aa7.12□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W YLR162WQ06235 118 aa7.12□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W HOT13P36078 116 aa7.11□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W ECM19Q06011 112 aa7.11□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W YAR023CD6VPM8 179 aa7.1□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W RRT15Q3E811 62 aa7.1□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W YGL041C-BQ3E750 60 aa7.09□□□□□ -1.27
PRP4YPR178W SNA2P56508 79 aa7.08□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W LIP1Q03579 150 aa7.08□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W MEC1P38111 2368 aa7.08□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YIL102CP40488 101 aa7.08□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YEL045CP32616 141 aa7.07□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YGR121W-AQ3E816 71 aa7.06□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W DDR2P89113 61 aa7.05□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YHR007C-AQ07074 71 aa7.05□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YOR072WQ08486 104 aa7.05□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W BSC4P53841 131 aa7.04□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa7.04□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W MIC10Q96VH5 97 aa7.04□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YGL193CP53097 103 aa7.03□□□□□ -1.28
PRP4YPR178W YOR381W-AQ3E804 55 aa7.02□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W PEX22P39718 180 aa7.01□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W TEL1P38110 2787 aa7.01□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa7□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PRP4YPR178W YOR268CQ08734 132 aa6.98□□□□□ -1.29
PRP4YPR178W YAR064WP39563 99 aa6.94□□□□□ -1.3
PRP4YPR178W YMR122CQ03879 124 aa6.93□□□□□ -1.3
PRP4YPR178W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa6.93□□□□□ -1.3
PRP4YPR178W YCL042WP25572 119 aa6.91□□□□□ -1.3
PRP4YPR178W YJL197C-AP0C5P0 93 aa6.9□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W HHF1P02309 103 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W OST5Q92316 86 aa6.87□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W YER188C-AP0C0V2 99 aa6.86□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W YLR122CQ12312 125 aa6.86□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W SDH6Q3E785 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W HUB1Q6Q546 73 aa6.86□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W YHR125WP38831 101 aa6.84□□□□□ -1.31
PRP4YPR178W AUA1P32450 94 aa6.83□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YCR043CP25361 127 aa6.82□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa6.82□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YPR153WQ06537 140 aa6.82□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YLR157W-DP0CE99 70 aa6.81□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W MRP10O75012 95 aa6.79□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PRP4YPR178W YDR010CQ12426 110 aa6.77□□□□□ -1.33
PRP4YPR178W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa6.77□□□□□ -1.33
PRP4YPR178W YDR034C-AP0C289 58 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP4YPR178W SPG1P50088 95 aa6.76□□□□□ -1.33
PRP4YPR178W YBR027CP38220 110 aa6.75□□□□□ -1.33
PRP4YPR178W YDL012CQ12489 107 aa6.71□□□□□ -1.33
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