RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YSY6	P38374	65 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YFL019C	P43576	117 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	SNA2	P56508	79 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	MRP10	O75012	95 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YBL039W-B	P0C268	59 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	SHH4	Q06236	168 aa		3.89	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		3.88	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YER187W	P40102	141 aa		3.87	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	SBH1	P52870	82 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	ICY1	Q04329	127 aa		3.86	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	GAT4	P40569	121 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	IGD1	P43598	195 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	LCL2	Q08045	131 aa		3.85	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	PEX22	P39718	180 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	ATP18	P81450	59 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		3.84	□□□□□ -1.79
AMD1	YML035C	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.84	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.84	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.84	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	UBC4	P15731	148 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		3.83	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		3.82	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	BET1	P22804	142 aa		3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	YGL193C	P53097	103 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	TSC3	Q3E790	80 aa		3.8	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	FYV5	P25585	152 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.79	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	LCL1	Q02786	101 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	ATP20	Q12233	115 aa		3.79	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	TDA2	P40045	126 aa		3.78	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
AMD1	YML035C	RSM18	P40033	138 aa		3.78	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YOL014W	Q08110	124 aa		3.78	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.78	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	ICS3	P47034	131 aa		3.77	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		3.76	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.75	□□□□□ -1.81	not detected
AMD1	YML035C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		3.75	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	BSC4	P53841	131 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.74	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YOR268C	Q08734	132 aa		3.73	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	SFT1	P43682	97 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	MMS2	P53152	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	DDR2	P89113	61 aa		3.72	□□□□□ -1.81
AMD1	YML035C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YOR314W	Q12506	109 aa		3.71	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YGR164W	P53291	111 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	COX23	P38824	151 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YOR072W	Q08486	104 aa		3.69	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	SPG1	P50088	95 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		3.68	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YHL005C	P38752	130 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YIL102C	P40488	101 aa		3.67	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.66	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	ECM19	Q06011	112 aa		3.65	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	YLR162W	Q06235	118 aa		3.65	□□□□□ -1.82
AMD1	YML035C	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	MIC10	Q96VH5	97 aa		3.64	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YEL045C	P32616	141 aa		3.63	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YBR027C	P38220	110 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	LIP1	Q03579	150 aa		3.61	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YMR122C	Q03879	124 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YGL149W	P53116	101 aa		3.6	□□□□□ -1.83
AMD1	YML035C	YCR043C	P25361	127 aa		3.59	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	HOT13	P36078	116 aa		3.59	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YFL067W	P43537	175 aa		3.59	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.57	□□□□□ -1.84
AMD1	YML035C	YAR064W	P39563	99 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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