RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	YDL157C	Q12082	118 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	YER187W	P40102	141 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	ARL3	Q02804	198 aa		0.53	□□□□□ -2.32
TTI1	YKL033W	QCR8	P08525	94 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	COX7	P10174	60 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	SEC11	P15367	167 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	ECM19	Q06011	112 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	IGO2	Q9P305	131 aa		0.53	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YAR1	P46683	200 aa		0.52	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	ICY1	Q04329	127 aa		0.52	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		0.52	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	SFT1	P43682	97 aa		0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	PAU17	Q12370	124 aa		0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	SSS1	P35179	80 aa		0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	ZEO1	Q08245	113 aa		0.51	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	FUN14	P18411	198 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	ISD11	Q6Q560	94 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	MRPL44	P19956	98 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YOL014W	Q08110	124 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	FYV7	Q12247	151 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.5	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YBL044W	P38194	122 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YLR255C	O13574	117 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YIL102C	P40488	101 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YLR296W	Q05898	108 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	PAU23	Q07987	124 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	NAT5	Q08689	176 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	MIC10	Q96VH5	97 aa		0.49	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YGL034C	P53186	121 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	HUR1	P45820	110 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	OST2	P46964	130 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	LIP1	Q03579	150 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.48	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YKL044W	P36092	106 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YBR016W	P38216	128 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	ICS3	P47034	131 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	CGR1	P53188	120 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	0.47	□□□□□ -2.33
TTI1	YKL033W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YHR125W	P38831	101 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	GTT1	P40582	234 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	ELC1	Q03071	99 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YHR130C	P38834	111 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YGL230C	P53074	147 aa		0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YML108W	Q03759	105 aa		0.45	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	RAD6	P06104	172 aa		0.45	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YAR064W	P39563	99 aa		0.44	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	TSC3	Q3E790	80 aa		0.44	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	COA6	Q3E846	104 aa		0.44	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	EMC6	Q12431	108 aa		0.44	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		0.43	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.43	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	POP7	P38291	140 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YER181C	P40097	107 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YHL042W	P38729	150 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	COX23	P38824	151 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	ATP18	P81450	59 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	CNL1	Q06333	122 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.42	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	PAI3	P01094	68 aa		0.41	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.41	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	TDA2	P40045	126 aa		0.41	□□□□□ -2.34
TTI1	YKL033W	COX8	P04039	78 aa		0.4	□□□□□ -2.35
TTI1	YKL033W	YGR039W	P53225	103 aa		0.4	□□□□□ -2.35
TTI1	YKL033W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.4	□□□□□ -2.35

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