RNA–Protein interactions for RNA: YGR215W

RSM27, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene RSM27, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RSM27	YGR215W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RSM18	P40033	138 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PHS1	P40857	217 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	CWP2	P43497	92 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YGR164W	P53291	111 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YNL190W	P53872	204 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PMP3	P87284	55 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	DDR2	P89113	61 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YDR042C	Q03205	200 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SPC24	Q04477	213 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	DAD1	Q12248	94 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YER039C-A	P0CD97	72 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU8	P0CE92	120 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU11	P0CE93	120 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	COX7	P10174	60 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	QCR9	P22289	66 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MRP17	P28778	131 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBL044W	P38194	122 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YAR029W	P39549	74 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YEA6	P39953	335 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	CYB5	P40312	120 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	TOS6	P48560	102 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MRPS12	P53732	153 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	BSC4	P53841	131 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ARL3	Q02804	198 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ICY1	Q04329	127 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	HPA2	Q06592	156 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU17	Q12370	124 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU9	Q3E770	120 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PCC1	Q3E833	88 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU1	P0CE88	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU14	P0CE89	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU6	P0CE90	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU18	P0CE91	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	HMRA1	P0CY11	126 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ACP1	P32463	125 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBR292C	P38357	123 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU13	P38725	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SHU1	P38751	150 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RPB11	P38902	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	VMA7	P39111	118 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU5	P43575	122 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	ICS3	P47034	131 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU4	P53427	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	AIM11	P87275	137 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU10	Q03050	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	GPI19	Q04082	140 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YMR103C	Q04436	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU23	Q07987	124 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	PAU20	Q08322	120 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YOR105W	Q08504	108 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	FYV7	Q12247	151 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	COX19	Q3E731	98 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MIC10	Q96VH5	97 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	MYO1	P08964	1928 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
RSM27	YGR215W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	HMRA2	P0CY13	119 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	COX23	P38824	151 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	PAU7	P39545	55 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YER187W	P40102	141 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	SFT1	P43682	97 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	ERV14	P53173	138 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YPL261C	Q08976	102 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YOL164W-A	Q3E7A5	60 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YNL277W-A	Q3E7Z0	62 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	STT4	P37297	1900 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
RSM27	YGR215W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42

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