RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	CWC27	Q02770	301 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	ARL3	Q02804	198 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	SCS22	Q6Q595	175 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	YKL044W	P36092	106 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	OST2	P46964	130 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYF2	YGR129W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	ZEO1	Q08245	113 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	YJL009W	P47078	108 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	MRPL44	P19956	98 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	YAR1	P46683	200 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	MPC3	P53311	146 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	YHR130C	P38834	111 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	DSE2	P38844	325 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	GTT1	P40582	234 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF2	YGR129W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	CNL1	Q06333	122 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	SEC11	P15367	167 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	SHH4	Q06236	168 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	YGL230C	P53074	147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	YLR162W	Q06235	118 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SYF2	YGR129W	YER187W	P40102	141 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YGL034C	P53186	121 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	COA6	Q3E846	104 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	HUR1	P45820	110 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	TSC3	Q3E790	80 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	ECM19	Q06011	112 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SYF2	YGR129W	YGR164W	P53291	111 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	ELC1	Q03071	99 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.63	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	ICS3	P47034	131 aa		2.62	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	SEN15	Q04675	128 aa		2.61	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YJL144W	P47009	104 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	SSS1	P35179	80 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YBR016W	P38216	128 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	ATP18	P81450	59 aa		2.59	□□□□□ -1.99
SYF2	YGR129W	YER181C	P40097	107 aa		2.57	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	YLR296W	Q05898	108 aa		2.56	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	POP7	P38291	140 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	COX23	P38824	151 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	NAT5	Q08689	176 aa		2.55	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
SYF2	YGR129W	CGR1	P53188	120 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YOL014W	Q08110	124 aa		2.52	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	PAI3	P01094	68 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	2.5	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	ISD11	Q6Q560	94 aa		2.5	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YAR064W	P39563	99 aa		2.49	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YLR255C	O13574	117 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YOR304C-A	O14468	76 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	2.47	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		2.47	□□□□□ -2.01
SYF2	YGR129W	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SYF2	YGR129W	TDA2	P40045	126 aa		2.44	□□□□□ -2.02
SYF2	YGR129W	YHL042W	P38729	150 aa		2.43	□□□□□ -2.02
SYF2	YGR129W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	2.43	□□□□□ -2.02
SYF2	YGR129W	YCR050C	P25630	102 aa		2.42	□□□□□ -2.02
SYF2	YGR129W	LIP1	Q03579	150 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SYF2	YGR129W	YBL044W	P38194	122 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SYF2	YGR129W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.37	□□□□□ -2.03
SYF2	YGR129W	YPL080C	Q02826	108 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SYF2	YGR129W	ATP20	Q12233	115 aa		2.35	□□□□□ -2.03
SYF2	YGR129W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.31	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	COX8	P04039	78 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	YML108W	Q03759	105 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	YIL102C-A	Q2V2P5	75 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	RAD6	P06104	172 aa		2.29	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	SAE3	P89114	91 aa		2.29	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		2.29	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	PBI2	P0CT04	75 aa	Known RBP	2.28	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.28	□□□□□ -2.04
SYF2	YGR129W	GLC8	P41818	229 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SYF2	YGR129W	YGR039W	P53225	103 aa		2.26	□□□□□ -2.05
SYF2	YGR129W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		2.24	□□□□□ -2.05
SYF2	YGR129W	OLI1	P61829	76 aa		2.23	□□□□□ -2.05
SYF2	YGR129W	YNL198C	P40166	100 aa		2.22	□□□□□ -2.05
SYF2	YGR129W	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	2.21	□□□□□ -2.06

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