RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	YDR115W	Q04598	105 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	ECM12	O13529	151 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YBL081W	P38180	368 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		3.44	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	DIF1	O13577	133 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YLR156W	P0CE96	114 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YLR159W	P0CE97	114 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YLR161W	P0CE98	114 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YLR307C-A	Q3E825	87 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YKL069W	P36088	180 aa		3.42	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		3.42	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		3.42	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	not detected
UBX7	YBR273C	IGD1	P43598	195 aa		3.41	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	YGL041C-B	Q3E750	60 aa		3.41	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		3.41	□□□□□ -1.86
UBX7	YBR273C	BET1	P22804	142 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	COX23	P38824	151 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	RSM18	P40033	138 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	ICS3	P47034	131 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	ATP20	Q12233	115 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		3.39	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YER187W	P40102	141 aa		3.39	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YOR314W	Q12506	109 aa		3.39	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	SNA2	P56508	79 aa		3.38	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YLR415C	O13578	112 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YCR050C	P25630	102 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		3.37	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	RRT15	Q3E811	62 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	TDA8	Q6B2U8	126 aa		3.35	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	HOT13	P36078	116 aa		3.34	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YGL193C	P53097	103 aa		3.34	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.34	□□□□□ -1.87
UBX7	YBR273C	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	DDR2	P89113	61 aa		3.33	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	ECM19	Q06011	112 aa		3.33	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YOL014W	Q08110	124 aa		3.33	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	AUA1	P32450	94 aa		3.32	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YOR072W	Q08486	104 aa		3.32	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	PEX22	P39718	180 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	SBH1	P52870	82 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	BSC4	P53841	131 aa		3.3	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YHR007C-A	Q07074	71 aa		3.3	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YEL045C	P32616	141 aa		3.29	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YLR162W	Q06235	118 aa		3.29	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.28	□□□□□ -1.88	not detected
UBX7	YBR273C	KTI11	Q3E840	82 aa		3.28	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		3.28	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	MIC10	Q96VH5	97 aa		3.28	□□□□□ -1.88
UBX7	YBR273C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		3.27	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YDR034C-A	P0C289	58 aa		3.25	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YIL102C	P40488	101 aa		3.25	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	LIP1	Q03579	150 aa		3.25	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		3.24	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YHL005C	P38752	130 aa		3.23	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YAR064W	P39563	99 aa		3.23	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	SPG1	P50088	95 aa		3.23	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	DYN1	P36022	4092 aa		3.23	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YGR164W	P53291	111 aa		3.22	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YLR412C-A	Q3E742	68 aa		3.22	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.89
UBX7	YBR273C	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YCR043C	P25361	127 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.19	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YPR195C	Q06594	109 aa		3.18	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YBR027C	P38220	110 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YHR125W	P38831	101 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	LCL1	Q02786	101 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YPR153W	Q06537	140 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	SDH6	Q3E785	79 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	HUB1	Q6Q546	73 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		3.16	□□□□□ -1.9
UBX7	YBR273C	YMR122C	Q03879	124 aa		3.14	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.6 ms