RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TKTL1P51854 596 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC7A5Q01650 507 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD5Q6N075 450 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FUT10Q6P4F1 479 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TEKT4Q8WW24 435 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 IRGQQ8WZA9 623 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RAPGEF5Q92565 580 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC2A13Q96QE2 648 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNK16Q96T55 309 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HERPUD2Q9BSE4 406 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR62Q9BZJ7 368 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.85■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 VWA8A3KMH1 1905 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ENDOD1O94919 500 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 BDNFP23560 247 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 GJC1P36383 396 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MATKP42679 507 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CDKN2BP42772 138 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 BCAR1P56945 870 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 DAOAP59103 153 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 BOLA3Q53S33 107 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MFSD7Q6UXD7 560 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 STRADAQ7RTN6 431 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 BNIPLQ7Z465 357 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC50Q8IVM0 306 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 IFT20Q8IY31 132 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM199Q8N511 208 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 NT5C3BQ969T7 300 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TBCBQ99426 244 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 CWH43Q9H720 699 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PATJQ8NI35 1801 aa23.84■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 BRCA2P51587 3418 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D4O60343 1298 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 AMHP03971 560 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 KDELR1P24390 212 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PTGIRP43119 386 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFV1P49821 464 aa23.83■■□□□ 1.41
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CAPNS1-207ENST00000589146 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM171A1Q5VUB5 890 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC14L1Q92503 715 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 SLCO2A1Q92959 643 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 PEBP4Q96S96 227 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ZWILCHQ9H900 591 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 HCSTQ9UBK5 93 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 AMACRQ9UHK6 382 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 USP3Q9Y6I4 520 aa23.83■■□□□ 1.41
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRD1A4D1F6 860 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPSAP2O60256 369 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 BAIAP3O94812 1187 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 RAG1P15918 1043 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 NOS2P35228 1153 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 HDAC4P56524 1084 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF280DQ6N043 979 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 VSIG1Q86XK7 387 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 DEFB106AQ8N104 65 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 DCLK3Q9C098 648 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 KLHL11Q9NVR0 708 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.82■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 H7C4K7 107 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP8B1O43520 1251 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 TJP3O95049 919 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 CSF2RAP15509 400 aa23.81■■□□□ 1.4
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEA11P43364 429 aa23.81■■□□□ 1.4
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