RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587957.1

EFTUD2-209, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 503 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-209ENST00000587957 USP4Q13107 963 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP2R5DQ14738 602 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF77Q15935 545 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 WDR44Q5JSH3 913 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 KRT39Q6A163 491 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ADSSL1Q8N142 457 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 C12orf29Q8N999 325 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SCAMP5Q8TAC9 235 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TMEM174Q8WUU8 243 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ATRIPQ8WXE1 791 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CLDN23Q96B33 292 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TWNKQ96RR1 684 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GMIPQ9P107 970 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 MAN1B1Q9UKM7 699 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXO4Q9UKT5 387 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CPQQ9Y646 472 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 F5P12259 2224 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF840PA6NDX5 716 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PROB1E7EW31 1015 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LEFTY2O00292 366 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LMNAP02545 664 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 IRF1P10914 325 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CHRNB1P11230 501 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CCR3P51677 355 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SATB1Q01826 763 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FZD5Q13467 585 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PDGFRLQ15198 375 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FUKQ8N0W3 1084 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FBXL13Q8NEE6 735 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SEMA4DQ92854 862 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ATP2A3Q93084 1043 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TIGD1Q96MW7 591 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ARID3AQ99856 593 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 FAM83CQ9BQN1 747 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NT5C1AQ9BXI3 368 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 DNAI2Q9GZS0 605 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GCNT4Q9P109 453 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CFAP97Q9P2B7 532 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 BEST1O76090 585 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GTF2H1P32780 548 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PPP3CCP48454 512 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 STX17P56962 302 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 AMPD2Q01433 879 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LRRC63Q05C16 580 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LRMPQ12912 555 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CBWD6Q4V339 395 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CBWD3Q5JTY5 395 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 DGKKQ5KSL6 1271 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CBWD5Q5RIA9 395 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 UNC93AQ86WB7 457 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PDZD8Q8NEN9 1154 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 OSCP1Q8WVF1 389 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NELFBQ8WX92 580 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CHFRQ96EP1 664 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SMOQ99835 787 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ECT2Q9H8V3 914 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP3A43Q9HB55 503 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 RAB20Q9NX57 234 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ZSCAN32Q9NX65 697 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ATG2BQ96BY7 2078 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PIEZO1Q92508 2521 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 SOBPA7XYQ1 873 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CYP26A1O43174 497 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 COCHO43405 550 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CILPO75339 1184 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NFATC1O95644 943 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 EGFP01133 1207 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GJA4P35212 333 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CXCL12P48061 93 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 INCA1Q0VD86 236 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 NR1H3Q13133 447 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GAS6Q14393 721 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 CAMK4Q16566 473 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 LPAL2Q16609 132 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 EML3Q32P44 896 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 HECTD3Q5T447 861 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 PRR23BQ6ZRT6 265 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-209ENST00000587957 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms