RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TTPALQ9BTX7 342 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 VN1R3Q9BXE9 311 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC23Q9UJX2 597 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP83Q9Y592 693 aa3.2□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 M0R3H8 397 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 FFAR2O15552 330 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 NXPH3O95157 252 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 VNN1O95497 513 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTSR2O95665 410 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 FSHBP01225 129 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKCBP05771 671 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 FESP07332 822 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM163BP0C2L3 166 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARP10275 920 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 IDEP14735 1019 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 GDF5P43026 501 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 INHBCP55103 352 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNFAIP2Q03169 654 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLF10Q13118 480 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 FHL2Q14192 279 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLCA4Q14CN2 919 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAB30Q15771 203 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRR16Q569H4 304 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRGPRGQ86SM5 289 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF527Q8NB42 609 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 C18orf8Q96DM3 657 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 HAPLN3Q96S86 360 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRB3Q9BUF7 120 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF3Q9NR81 526 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CA14Q9ULX7 337 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 DTNAQ9Y4J8 743 aa3.19□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 F5H423 210 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PODXLO00592 558 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPC1O15118 1278 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 DHHO43323 396 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX2O60749 519 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAMP2O60895 175 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CBFA2T3O75081 653 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMPCBO75439 489 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CD19P15391 556 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MST1P26927 711 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITPKBP27987 946 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTSR1P30989 418 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTR7P34969 479 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLA2G5P39877 138 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL10A1Q03692 680 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTAPQ13126 283 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP1A4Q13733 1029 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTK2BQ14289 1009 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACOX1Q15067 660 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP1B1Q16678 543 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD16Q6P6B7 361 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q6ZWC4 215 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR150Q8NGU9 434 aa3.18□□□□□ -1.9
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABHD5Q8WTS1 349 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms