RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CCL15Q16663 113 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MED25Q71SY5 747 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TAAR9Q96RI9 348 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GPR108Q9NPR9 543 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ANLNQ9NQW6 1124 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ECM29Q5VYK3 1845 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 H3BML4 177 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TLR2O60603 784 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 BCAR3O75815 825 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HAUS5O94927 633 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 LDHCP07864 332 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 C1SP09871 688 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PRMT2P55345 433 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GSTO1P78417 241 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TFCP2Q12800 502 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MIIPQ5JXC2 388 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 AGAP9Q5VTM2 703 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RHOT2Q8IXI1 618 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FITM2Q8N6M3 262 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF503Q96F45 646 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC46A2Q9BY10 475 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PACSIN1Q9BY11 444 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 WDCPQ9H6R7 721 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TRIM17Q9Y577 477 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 LAMB1P07942 1786 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6CA6NDK9 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6BA6NDN3 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 AHRRA9YTQ3 701 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 F2RL2O00254 374 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CXCL11O14625 94 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC43A1O75387 559 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ITGB1P05556 798 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SBK3P0C264 359 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA31D3P0C874 917 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6DP0CG33 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 INSRRP14616 1297 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GCSHP23434 173 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC6A2P23975 617 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ADORA1P30542 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SOX10P56693 466 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC25A3Q00325 362 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TCP10Q12799 353 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 KIF22Q14807 665 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GORABQ5T7V8 394 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 DENND1CQ8IV53 801 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SSH3Q8TE77 659 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 NEU1Q99519 415 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 JKAMPQ9P055 326 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ABCF2Q9UG63 623 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GAGE12BA1L429 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 GAGE12HA6NDE8 117 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 BTBD19C9JJ37 291 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ERC2O15083 957 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 FAM20BO75063 409 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PARNO95453 639 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 ALDH2P05091 517 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 SLC6A4P31645 630 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 BTDP43251 543 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 PTTG1IPP53801 180 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-225ENST00000515835 RHBDL3P58872 404 aa7.24□□□□□ -1.25
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