RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515575.1

RPS4Y1-204, Transcript of ribosomal protein S4 Y-linked 1, human

TSL 3

Gene RPS4Y1, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575		F8W8V4	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MYO1C	O00159	1063 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BCAR3	O75815	825 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VNN1	O95497	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CYP2C9	P11712	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NDUFB7	P17568	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LRPAP1	P30533	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RAB32	Q13637	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	E2F2	Q14209	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MARK4	Q96L34	752 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575		E5RJQ4	531 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SOCS2	O14508	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FES	P07332	822 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CYP4F2	P78329	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRT17	Q04695	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575		A1L4Q6	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MYMK	A6NI61	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TLR5	O60602	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KLRC1	P26715	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PDE6C	P51160	858 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NPY5R	Q15761	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575		H7C4K7	107 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC5A1	P13866	664 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RITA1	Q96K30	269 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MGEA5	O60502	916 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NXPH3	O95157	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ALPL	P05186	524 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CYP2C18	P33260	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	THBS3	P49746	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLCD1	P51178	756 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	USP43	Q70EL4	1123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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