RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482083.7

RNF13-213, Transcript of ring finger protein 13, human

TSL 5

Gene RNF13, Length 777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF13-213	ENST00000482083	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	MAFF	Q9ULX9	164 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RNF13-213	ENST00000482083		A0A088AWK7	358 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083		H3BNX3	289 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	IL33	O95760	270 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PRKAG1	P54619	331 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	AMPD3	Q01432	767 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CCNI	Q14094	377 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SEC23B	Q15437	767 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083		B4DGG1	531 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ALDH2	P05091	517 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DIO1	P49895	249 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	HSF1	Q00613	529 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	RAB1A	P62820	205 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	FGL2	Q14314	439 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MT3	P25713	68 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	EPHA3	P29320	983 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CFHR3	Q02985	330 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CTBP1	Q13363	440 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MMP21	Q8N119	569 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SPRY2	O43597	315 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	KRT86	O43790	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	T-ENOL	P0DO92	83 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CREB1	P16220	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	TIRAP	P58753	221 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	MTX1	Q13505	466 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	KRT81	Q14533	505 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	KCNB1	Q14721	858 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RNF13-213	ENST00000482083	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.17	□□□□□ -1.74

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