RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 CRYGNQ8WXF5 182 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TNFRSF25Q93038 417 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 IQCDQ96DY2 449 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SPDL1Q96EA4 605 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM9Q9C026 710 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RNF14Q9UBS8 474 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 LAMB1P07942 1786 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MBTPS2O43462 519 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ASGR2P07307 311 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FAM187BQ17R55 369 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF394Q53GI3 561 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RNF135Q8IUD6 432 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NT5C1BQ96P26 610 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PNMA5Q96PV4 448 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MTMR12Q9C0I1 747 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 USTQ9Y2C2 406 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ENO4A6NNW6 628 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 M0R2N6 131 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01565O15544 149 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NR3C1P04150 777 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ADORA2BP29275 332 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GDI1P31150 447 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NCOA4Q13772 614 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 WSCD1Q658N2 575 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 KCNK18Q7Z418 384 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO32Q969P5 355 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SYT15Q9BQS2 421 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC8A2Q9UPR5 921 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 C2CD2Q9Y426 696 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZBTB42B2RXF5 422 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TTI1O43156 1089 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TBC1D4O60343 1298 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SUN1O94901 812 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 GNA14O95837 355 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ALDH3A1P30838 453 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 DR1Q01658 176 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TAF11Q15544 211 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MAP4K3Q8IVH8 894 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 NELL2Q99435 816 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 CACNG4Q9UBN1 327 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 ASB3Q9Y575 518 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 F5P12259 2224 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-205ENST00000468371 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM24O75264 130 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 PDHA1P08559 390 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 HDCP19113 662 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 GCLMP48507 274 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 SLC12A3P55017 1021 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 MUM1Q2TAK8 710 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 PRR23BQ6ZRT6 265 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 SPRED2Q7Z698 418 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-205ENST00000468371 SIX5Q8N196 739 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms