RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIA2P42262 883 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LMAN2Q12907 356 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD6Q15008 389 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F4Q16254 413 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR72Q3MJ13 1102 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH13Q8NBN7 331 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM33Q9BZ11 813 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KBTBD4Q9NVX7 518 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBE4BO95155 1302 aa14□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0A0MRY4 1105 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E2F8A0AVK6 867 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLDN5O00501 218 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K13O43283 966 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGFB1I1O43294 461 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM23O75077 832 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPINK2P20155 84 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YWHAQP27348 245 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGER3P43115 390 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP2J2P51589 502 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASIC1P78348 528 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP24A1Q07973 514 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP7D1Q3KQU3 841 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM26FQ5R3K3 315 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LY6G5CQ5SRR4 150 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EMC10Q5UCC4 262 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEFF1Q8IYR6 380 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP93Q8N1F7 819 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHTF2Q8N3S3 785 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMD1Q8N878 549 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB124Q8NES8 71 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF507Q8TCN5 953 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGB4Q8WW32 186 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXO32Q969P5 355 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUB2Q96DC9 234 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM208BQ5VWN6 2430 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COCHO43405 550 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPP6P42658 865 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNFRSF4P43489 277 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAD2Q05329 585 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRPC3Q13507 836 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK38Q15208 465 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYT12Q8IV01 421 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CUEDC2Q9H467 287 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM74BQ9NUR3 256 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTMR6Q9Y217 621 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa13.99□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPEGQ15772 3267 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGF2RP11717 2491 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP8B3O60423 1300 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP192Q8TEP8 1941 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLIC2O15247 247 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENGP17813 658 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATICP31939 592 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK8P45983 427 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC5A3P53794 718 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYL6P60660 151 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMPD3Q01432 767 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HECTD3Q5T447 861 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM35AQ86V20 835 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PGBD3Q8N328 593 aa13.98□□□□□ -0.17
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00301Q8NCQ3 95 aa13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms