RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378402.9

PKHD1L1-201, Transcript of PKHD1 like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKHD1L1, Length 13,076 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1-201ENST00000378402 DHDDSQ86SQ9 333 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TDRPQ86YL5 185 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GIPC3Q8TF64 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FAR1Q8WVX9 515 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 STARD8Q92502 1023 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 WNT8AQ9H1J5 351 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 JMJD4Q9H9V9 463 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABCC10Q5T3U5 1492 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IQGAP3Q86VI3 1631 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AP1G1O43747 822 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMEM127O75204 238 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GJB6O95452 261 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ITGB6P18564 788 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AKIRIN2Q53H80 203 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HACD4Q5VWC8 232 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 LAYNQ6UX15 382 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAT14Q8WUY8 206 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ERGIC2Q96RQ1 377 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RIC1Q4ADV7 1423 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABCC3O15438 1527 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 UGGT1Q9NYU2 1555 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 IL4RP24394 825 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 S100PP25815 95 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TIE1P35590 1138 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ANKDD1AQ495B1 522 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZFP69Q49AA0 526 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TTC23Q5W5X9 447 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 AIDAQ96BJ3 306 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FRMD6Q96NE9 622 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CTPS2Q9NRF8 586 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RGS13O14921 159 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ABL1P00519 1130 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 FECHP22830 423 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GMPRP36959 345 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PHKA2P46019 1235 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 COPAP53621 1224 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAD23AP54725 363 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 UBXN2AP68543 259 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 PRKCEQ02156 737 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TEX30Q5JUR7 227 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAPRTQ6XQN6 538 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KRT78Q8N1N4 520 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 DENND6BQ8NEG7 585 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SSH3Q8TE77 659 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TESCQ96BS2 214 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 POLG2Q9UHN1 485 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.56□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KIF13AQ9H1H9 1805 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MADDQ8WXG6 1647 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A0B4J269 797 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 A0A1W2PQ72 361 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 H0YCG3 227 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TGOLN2O43493 480 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RAD1O60671 282 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAT1P18440 290 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 DNAJB1P25685 340 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NMT1P30419 496 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TUBB3Q13509 450 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NFYCQ13952 458 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MORF4L2Q15014 288 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 MAN2A1Q16706 1144 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 C4orf46Q504U0 113 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 RETREG3Q86VR2 466 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 COMTD1Q86VU5 262 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 NAPBQ9H115 298 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ZNF696Q9H7X3 374 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CYP26B1Q9NR63 512 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 SPANXCQ9NY87 97 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 DUSP12Q9UNI6 340 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 CST8O60676 142 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 ACADSBP45954 432 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 COTL1Q14019 142 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.55□□□□□ -1.84
PKHD1L1-201ENST00000378402 JADE1Q6IE81 842 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms