RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 BAG5Q9UL15 447 aa16.27■□□□□ 0.2
USP43-201ENST00000285199 CLEC11AQ9Y240 323 aa16.27■□□□□ 0.2
USP43-201ENST00000285199 GSTA4O15217 222 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 RBL1P28749 1068 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CCNFP41002 786 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SPDYCQ5MJ68 293 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CATSPER4Q7RTX7 472 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 IL31RAQ8NI17 732 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SYT15Q9BQS2 421 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TPH1P17752 444 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PSMC3P17980 439 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TAP1Q03518 808 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 NFIL3Q16649 462 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 KRT27Q7Z3Y8 459 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GLIS1Q8NBF1 620 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 VPS39Q96JC1 886 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 MID2Q9UJV3 735 aa16.27■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 C2CD2LO14523 706 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TBX10O75333 385 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CYP1A2P05177 515 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GPD1P21695 349 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SLC1A6P48664 564 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 HDAC4P56524 1084 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 DCAF6Q58WW2 860 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ANO7Q6IWH7 933 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 MFSD5Q6N075 450 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 RINLQ6ZS11 566 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ULK2Q8IYT8 1036 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 A0A0B4J269 797 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ARHGEF37A1IGU5 675 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 KCNK1O00180 336 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 KCTD2Q14681 263 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SURF1Q15526 300 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SNX32Q86XE0 403 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TNS4Q8IZW8 715 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 NCLNQ969V3 563 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CNDP1Q96KN2 507 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SYCE1LA8MT33 242 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PCSK7Q16549 785 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CYLDQ9NQC7 956 aa16.26■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CAPN8A6NHC0 703 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ECHS1P30084 290 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 MIPP30301 263 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 NRBF2Q96F24 287 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PPCSQ9HAB8 311 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 POLIQ9UNA4 740 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 WDR27A2RRH5 827 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 DFFAO00273 331 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FKBP6O75344 327 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CPA3P15088 417 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ATICP31939 592 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PCYT1AP49585 367 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 JAM2P57087 298 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 DPYSL3Q14195 570 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PHF12Q96QT6 1004 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 EBF2Q9HAK2 575 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CHST12Q9NRB3 414 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 MYH2Q9UKX2 1941 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 KDM1AO60341 852 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PEX11AO75192 247 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PSMD10O75832 226 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 OCA2Q04671 838 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 KLC3Q6P597 504 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ACOT1Q86TX2 421 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 CERS5Q8N5B7 392 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 GOLGA8CPA6NN73 597 aa16.24■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 SERPINB9P50453 376 aa16.24■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 DAB2P98082 770 aa16.24■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 DGKZQ13574 1117 aa16.24■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 PARP6Q2NL67 630 aa16.24■□□□□ 0.19
USP43-201ENST00000285199 FUT11Q495W5 492 aa16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms