RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 FAM161BQ96MY7 647 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 KCNK4Q9NYG8 393 aa15.56■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PARP14Q460N5 1801 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 H3BRJ5 948 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 WNT10BO00744 389 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MAGEC1O60732 1142 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MIPP30301 263 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CES4AQ5XG92 561 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CCDC110Q8TBZ0 833 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 C2CD2Q9Y426 696 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TTLL3Q9Y4R7 772 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MAP3K7O43318 606 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SPAG6O75602 509 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ENO1P06733 434 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MMRN1Q13201 1228 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 GRM1Q13255 1194 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 XYLT1Q86Y38 959 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 GATA6Q92908 595 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CFAP36Q96G28 342 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 C7orf26Q96N11 449 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CPXM1Q96SM3 734 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CALN1Q9BXU9 219 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PLLPQ9Y342 182 aa15.55■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ADCY3O60266 1144 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ERBB2P04626 1255 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CD19P15391 556 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 INHBEP58166 350 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ROR1Q01973 937 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 BST1Q10588 318 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TRPC3Q13507 836 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 DUOXA2Q1HG44 320 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 FOXB2Q5VYV0 432 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PPM1NQ8N819 430 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 REPS2Q8NFH8 660 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 LHX5Q9H2C1 402 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PLA2G4CQ9UP65 541 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PPME1Q9Y570 386 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 F8W8V4 182 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 DPEP1P16444 411 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 KCNA3P22001 575 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 STIP1P31948 543 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 NOMO1Q15155 1222 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF699Q32M78 642 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MDH1BQ5I0G3 518 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CTAGE3PQ8IX95 158 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 FAF2Q96CS3 445 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TCHPQ9BT92 498 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 USP18Q9UMW8 372 aa15.54■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 I3L4J1 428 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CHADO15335 359 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 RAP1GAPP47736 663 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CACNA2D1P54289 1103 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS15P98073 1019 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZPBP2Q6X784 338 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 E2F7Q96AV8 911 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TEPSINQ96N21 525 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 PEBP4Q96S96 227 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 RSAD1Q9HA92 442 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 TEX44Q53QW1 395 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.53■□□□□ 0.08
SYP-201ENST00000263233 ACAP3Q96P50 834 aa15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms