RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 WDR49Q8IV35 697 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MMS19Q96T76 1030 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PANK4Q9NVE7 773 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 KLK13Q9UKR3 277 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CEP192Q8TEP8 1941 aa20.23■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF233A6NK53 670 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TACC1O75410 805 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PGBD3Q8N328 593 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CLIC6Q96NY7 704 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ELOVL4Q9GZR5 314 aa20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 E2F8A0AVK6 867 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 AP5Z1O43299 807 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CFIP05156 583 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 GAD2Q05329 585 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 CEP76Q8TAP6 659 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 OTUB2Q96DC9 234 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SNX25Q9H3E2 840 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 FSCN3Q9NQT6 498 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SLC6A14Q9UN76 642 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 PCNX2A6NKB5 2137 aa20.21■□□□□ 0.83
SLX1A-201ENST00000251303 SERPINF2P08697 491 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 GABRG2P18507 467 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DUOXA1Q1HG43 343 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CAPN10Q9HC96 672 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.2■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CACNA1EQ15878 2313 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 A0A087X0B3 334 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 COCHO43405 550 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 FAM163BP0C2L3 166 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 YWHAQP27348 245 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 STAT6P42226 847 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RING1Q06587 406 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 LRSAM1Q6UWE0 723 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 SLC36A4Q6YBV0 504 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 NUP93Q8N1F7 819 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HCN2Q9UL51 889 aa20.19■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 H0Y626 953 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CLDN5O00501 218 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TULP3O75386 442 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TRIM16O95361 564 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 HOXD13P35453 343 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 ACAP1Q15027 740 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 NAT16Q8N8M0 369 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 TERB1Q8NA31 727 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 FBXO32Q969P5 355 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 DEC1Q9P2X7 70 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 LHX6Q9UPM6 363 aa20.18■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.17■□□□□ 0.82
SLX1A-201ENST00000251303 OPHN1O60890 802 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms