RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	NLRP7	Q8WX94	980 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC77	Q9BR77	488 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SYNC	Q9H7C4	482 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	HAO1	Q9UJM8	370 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CHKB	Q9Y259	395 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	KAT6A	Q92794	2004 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1B0GVG6	124 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659		A8MXQ7	604 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC22	O60826	627 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CDH16	O75309	829 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	MCF2	P10911	925 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	GZMA	P12544	262 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	FMO1	Q01740	532 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF410	Q86VK4	478 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ACP6	Q9NPH0	428 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		16.04	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	NRCAM	Q92823	1304 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	GPR25	O00155	361 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	IL18RAP	O95256	599 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ABCB4	P21439	1286 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	EPHB2	P29323	1055 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CPT1A	P50416	773 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CUL2	Q13617	745 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD10	Q14728	455 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SLCO2A1	Q92959	643 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	STMN2	Q93045	179 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ZIC5	Q96T25	663 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT8	Q9NY28	637 aa		16.03	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659		H0Y3Z8	333 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	B4GALT4	O60513	344 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CTGF	P29279	349 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	PSEN2	P49810	448 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	BPIFB4	P59827	614 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	OSTN	P61366	133 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	TCEAL1	Q15170	157 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	ARMC3	Q5W041	872 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	GDAP1	Q8TB36	358 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	THAP2	Q9H0W7	228 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		16.02	■□□□□ 0.16
BBS1-225	ENST00000630659	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CDK7	P50613	346 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CDC42EP1	Q00587	391 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LONRF1	Q17RB8	773 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	LIN52	Q52LA3	116 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TTC8	Q8TAM2	541 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	CPB2	Q96IY4	423 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	SENP1	Q9P0U3	644 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	NR2E1	Q9Y466	385 aa		16.02	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	HAS3	O00219	553 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN1	O60635	241 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ENTPD5	O75356	428 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TTC4	O95801	387 aa		16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	16.01	■□□□□ 0.15
BBS1-225	ENST00000630659	TNNC2	P02585	160 aa		16.01	■□□□□ 0.15

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