RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584051.1

CPD-208, Transcript of carboxypeptidase D, human

TSL 5

Gene CPD, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPD-208	ENST00000584051	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	SLFN13	Q68D06	897 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	AACS	Q86V21	672 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ANKS1A	Q92625	1134 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	YME1L1	Q96TA2	773 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CD207	Q9UJ71	328 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	PRR23A	A6NEV1	266 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	GOLIM4	O00461	696 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MAFG	O15525	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	PRKAB2	O43741	272 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	BCAR3	O75815	825 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CSF2RB	P32927	897 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ADD2	P35612	726 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	NBL1	P41271	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	SLC1A4	P43007	532 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ETV4	P43268	484 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	FAP	Q12884	760 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	GPNMB	Q14956	572 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	KAT6A	Q92794	2004 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CPD-208	ENST00000584051	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	PLXNA3	P51805	1871 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	FSD2	A1L4K1	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	PRKD3	O94806	890 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	ICAM1	P05362	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	TRIM27	P14373	513 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	ICAM3	P32942	547 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	BMPR1A	P36894	532 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	NDUFV1	P49821	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	STAT5B	P51692	787 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	RRAD	P55042	308 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	HYAL1	Q12794	435 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	COASY	Q13057	564 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	ADAM15	Q13444	863 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	PDCD1	Q15116	288 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	CLUL1	Q15846	466 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	DGKD	Q16760	1214 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CPD-208	ENST00000584051	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.52	□□□□□ -1.69

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